Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLF1Q9BQI6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLF1Q9BQI6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SLF1Q9BQI6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLF1Q9BQI6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SLF1Q9BQI6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLF1Q9BQI6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLF1Q9BQI6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLF1Q9BQI6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLF1Q9BQI6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SLF1Q9BQI6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLF1Q9BQI6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLF1Q9BQI6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLF1Q9BQI6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SLF1Q9BQI6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLF1Q9BQI6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLF1Q9BQI6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLF1Q9BQI6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLF1Q9BQI6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLF1Q9BQI6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLF1Q9BQI6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLF1Q9BQI6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLF1Q9BQI6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLF1Q9BQI6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLF1Q9BQI6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLF1Q9BQI6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLF1Q9BQI6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLF1Q9BQI6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLF1Q9BQI6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLF1Q9BQI6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLF1Q9BQI6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLF1Q9BQI6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLF1Q9BQI6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLF1Q9BQI6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLF1Q9BQI6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SLF1Q9BQI6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLF1Q9BQI6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLF1Q9BQI6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLF1Q9BQI6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SLF1Q9BQI6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLF1Q9BQI6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SLF1Q9BQI6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLF1Q9BQI6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLF1Q9BQI6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLF1Q9BQI6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLF1Q9BQI6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SLF1Q9BQI6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLF1Q9BQI6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SLF1Q9BQI6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLF1Q9BQI6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLF1Q9BQI6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLF1Q9BQI6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLF1Q9BQI6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLF1Q9BQI6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLF1Q9BQI6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLF1Q9BQI6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLF1Q9BQI6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLF1Q9BQI6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLF1Q9BQI6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLF1Q9BQI6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLF1Q9BQI6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLF1Q9BQI6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLF1Q9BQI6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SLF1Q9BQI6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLF1Q9BQI6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLF1Q9BQI6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLF1Q9BQI6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLF1Q9BQI6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLF1Q9BQI6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLF1Q9BQI6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLF1Q9BQI6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLF1Q9BQI6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLF1Q9BQI6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
SLF1Q9BQI6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SLF1Q9BQI6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLF1Q9BQI6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLF1Q9BQI6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLF1Q9BQI6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLF1Q9BQI6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLF1Q9BQI6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLF1Q9BQI6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLF1Q9BQI6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLF1Q9BQI6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLF1Q9BQI6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLF1Q9BQI6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLF1Q9BQI6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLF1Q9BQI6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLF1Q9BQI6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLF1Q9BQI6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLF1Q9BQI6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLF1Q9BQI6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLF1Q9BQI6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SLF1Q9BQI6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLF1Q9BQI6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SLF1Q9BQI6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SLF1Q9BQI6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLF1Q9BQI6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLF1Q9BQI6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLF1Q9BQI6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SLF1Q9BQI6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms