Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CMSS1Q9BQ75 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CMSS1Q9BQ75 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CMSS1Q9BQ75 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CMSS1Q9BQ75 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CMSS1Q9BQ75 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CMSS1Q9BQ75 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CMSS1Q9BQ75 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CMSS1Q9BQ75 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CMSS1Q9BQ75 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CMSS1Q9BQ75 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CMSS1Q9BQ75 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMSS1Q9BQ75 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMSS1Q9BQ75 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMSS1Q9BQ75 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMSS1Q9BQ75 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMSS1Q9BQ75 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMSS1Q9BQ75 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMSS1Q9BQ75 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMSS1Q9BQ75 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMSS1Q9BQ75 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CMSS1Q9BQ75 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMSS1Q9BQ75 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMSS1Q9BQ75 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMSS1Q9BQ75 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMSS1Q9BQ75 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMSS1Q9BQ75 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMSS1Q9BQ75 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMSS1Q9BQ75 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMSS1Q9BQ75 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMSS1Q9BQ75 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMSS1Q9BQ75 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMSS1Q9BQ75 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMSS1Q9BQ75 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMSS1Q9BQ75 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMSS1Q9BQ75 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CMSS1Q9BQ75 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMSS1Q9BQ75 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMSS1Q9BQ75 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMSS1Q9BQ75 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMSS1Q9BQ75 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMSS1Q9BQ75 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMSS1Q9BQ75 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CMSS1Q9BQ75 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMSS1Q9BQ75 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.1 ms