Protein–RNA interactions for Protein: Q99742

NPAS1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1Q99742 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPAS1Q99742 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPAS1Q99742 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPAS1Q99742 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPAS1Q99742 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPAS1Q99742 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPAS1Q99742 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPAS1Q99742 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPAS1Q99742 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPAS1Q99742 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NPAS1Q99742 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NPAS1Q99742 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPAS1Q99742 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPAS1Q99742 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPAS1Q99742 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPAS1Q99742 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPAS1Q99742 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPAS1Q99742 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NPAS1Q99742 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NPAS1Q99742 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPAS1Q99742 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NPAS1Q99742 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPAS1Q99742 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPAS1Q99742 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPAS1Q99742 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPAS1Q99742 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPAS1Q99742 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPAS1Q99742 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPAS1Q99742 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NPAS1Q99742 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPAS1Q99742 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPAS1Q99742 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPAS1Q99742 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NPAS1Q99742 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPAS1Q99742 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPAS1Q99742 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPAS1Q99742 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPAS1Q99742 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPAS1Q99742 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPAS1Q99742 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPAS1Q99742 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPAS1Q99742 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPAS1Q99742 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPAS1Q99742 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPAS1Q99742 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPAS1Q99742 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPAS1Q99742 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPAS1Q99742 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPAS1Q99742 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPAS1Q99742 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPAS1Q99742 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPAS1Q99742 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NPAS1Q99742 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NPAS1Q99742 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPAS1Q99742 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPAS1Q99742 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPAS1Q99742 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPAS1Q99742 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPAS1Q99742 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPAS1Q99742 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPAS1Q99742 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPAS1Q99742 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPAS1Q99742 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPAS1Q99742 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPAS1Q99742 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPAS1Q99742 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPAS1Q99742 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPAS1Q99742 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPAS1Q99742 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NPAS1Q99742 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPAS1Q99742 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPAS1Q99742 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPAS1Q99742 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPAS1Q99742 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NPAS1Q99742 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPAS1Q99742 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPAS1Q99742 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPAS1Q99742 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPAS1Q99742 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPAS1Q99742 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPAS1Q99742 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPAS1Q99742 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPAS1Q99742 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPAS1Q99742 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPAS1Q99742 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPAS1Q99742 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPAS1Q99742 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPAS1Q99742 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NPAS1Q99742 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPAS1Q99742 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPAS1Q99742 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPAS1Q99742 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPAS1Q99742 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPAS1Q99742 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPAS1Q99742 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPAS1Q99742 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPAS1Q99742 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NPAS1Q99742 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NPAS1Q99742 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPAS1Q99742 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151 ms