Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB8

SMC6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC6Q96SB8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMC6Q96SB8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMC6Q96SB8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMC6Q96SB8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMC6Q96SB8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMC6Q96SB8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMC6Q96SB8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMC6Q96SB8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMC6Q96SB8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMC6Q96SB8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMC6Q96SB8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMC6Q96SB8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMC6Q96SB8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMC6Q96SB8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMC6Q96SB8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMC6Q96SB8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMC6Q96SB8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMC6Q96SB8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMC6Q96SB8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMC6Q96SB8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SMC6Q96SB8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMC6Q96SB8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMC6Q96SB8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMC6Q96SB8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMC6Q96SB8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMC6Q96SB8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMC6Q96SB8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMC6Q96SB8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMC6Q96SB8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMC6Q96SB8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMC6Q96SB8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMC6Q96SB8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMC6Q96SB8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMC6Q96SB8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMC6Q96SB8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMC6Q96SB8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMC6Q96SB8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMC6Q96SB8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMC6Q96SB8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMC6Q96SB8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMC6Q96SB8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMC6Q96SB8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMC6Q96SB8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMC6Q96SB8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMC6Q96SB8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMC6Q96SB8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMC6Q96SB8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMC6Q96SB8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMC6Q96SB8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMC6Q96SB8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC6Q96SB8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC6Q96SB8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC6Q96SB8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC6Q96SB8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC6Q96SB8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC6Q96SB8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC6Q96SB8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC6Q96SB8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC6Q96SB8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC6Q96SB8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMC6Q96SB8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMC6Q96SB8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMC6Q96SB8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMC6Q96SB8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMC6Q96SB8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMC6Q96SB8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SMC6Q96SB8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMC6Q96SB8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMC6Q96SB8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMC6Q96SB8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMC6Q96SB8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMC6Q96SB8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMC6Q96SB8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMC6Q96SB8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMC6Q96SB8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMC6Q96SB8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMC6Q96SB8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMC6Q96SB8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMC6Q96SB8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMC6Q96SB8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMC6Q96SB8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMC6Q96SB8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMC6Q96SB8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMC6Q96SB8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMC6Q96SB8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMC6Q96SB8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMC6Q96SB8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMC6Q96SB8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMC6Q96SB8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMC6Q96SB8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMC6Q96SB8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMC6Q96SB8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMC6Q96SB8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMC6Q96SB8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMC6Q96SB8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMC6Q96SB8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMC6Q96SB8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMC6Q96SB8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMC6Q96SB8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC6Q96SB8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms