Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMG1Q96Q15 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMG1Q96Q15 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMG1Q96Q15 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMG1Q96Q15 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMG1Q96Q15 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMG1Q96Q15 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SMG1Q96Q15 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMG1Q96Q15 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMG1Q96Q15 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMG1Q96Q15 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SMG1Q96Q15 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SMG1Q96Q15 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMG1Q96Q15 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMG1Q96Q15 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMG1Q96Q15 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG1Q96Q15 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG1Q96Q15 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG1Q96Q15 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG1Q96Q15 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMG1Q96Q15 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SMG1Q96Q15 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMG1Q96Q15 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SMG1Q96Q15 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMG1Q96Q15 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMG1Q96Q15 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMG1Q96Q15 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMG1Q96Q15 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMG1Q96Q15 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMG1Q96Q15 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMG1Q96Q15 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMG1Q96Q15 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMG1Q96Q15 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMG1Q96Q15 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMG1Q96Q15 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMG1Q96Q15 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMG1Q96Q15 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMG1Q96Q15 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMG1Q96Q15 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMG1Q96Q15 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMG1Q96Q15 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG1Q96Q15 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG1Q96Q15 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG1Q96Q15 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG1Q96Q15 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG1Q96Q15 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG1Q96Q15 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMG1Q96Q15 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SMG1Q96Q15 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMG1Q96Q15 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG1Q96Q15 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG1Q96Q15 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG1Q96Q15 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG1Q96Q15 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG1Q96Q15 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMG1Q96Q15 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMG1Q96Q15 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMG1Q96Q15 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMG1Q96Q15 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMG1Q96Q15 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMG1Q96Q15 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMG1Q96Q15 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMG1Q96Q15 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMG1Q96Q15 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMG1Q96Q15 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMG1Q96Q15 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMG1Q96Q15 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMG1Q96Q15 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SMG1Q96Q15 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMG1Q96Q15 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMG1Q96Q15 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMG1Q96Q15 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMG1Q96Q15 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMG1Q96Q15 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMG1Q96Q15 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMG1Q96Q15 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMG1Q96Q15 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMG1Q96Q15 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SMG1Q96Q15 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMG1Q96Q15 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMG1Q96Q15 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMG1Q96Q15 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMG1Q96Q15 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMG1Q96Q15 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMG1Q96Q15 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMG1Q96Q15 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMG1Q96Q15 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMG1Q96Q15 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMG1Q96Q15 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMG1Q96Q15 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMG1Q96Q15 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMG1Q96Q15 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMG1Q96Q15 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMG1Q96Q15 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMG1Q96Q15 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMG1Q96Q15 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMG1Q96Q15 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMG1Q96Q15 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMG1Q96Q15 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMG1Q96Q15 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
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