Protein–RNA interactions for Protein: Q96PR1

KCNC2, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC2Q96PR1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNC2Q96PR1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNC2Q96PR1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNC2Q96PR1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNC2Q96PR1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNC2Q96PR1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNC2Q96PR1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNC2Q96PR1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KCNC2Q96PR1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNC2Q96PR1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNC2Q96PR1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNC2Q96PR1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNC2Q96PR1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNC2Q96PR1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNC2Q96PR1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNC2Q96PR1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNC2Q96PR1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNC2Q96PR1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNC2Q96PR1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNC2Q96PR1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNC2Q96PR1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNC2Q96PR1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNC2Q96PR1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNC2Q96PR1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNC2Q96PR1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNC2Q96PR1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNC2Q96PR1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNC2Q96PR1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNC2Q96PR1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNC2Q96PR1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNC2Q96PR1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNC2Q96PR1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNC2Q96PR1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNC2Q96PR1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNC2Q96PR1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNC2Q96PR1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNC2Q96PR1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNC2Q96PR1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNC2Q96PR1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNC2Q96PR1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNC2Q96PR1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNC2Q96PR1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNC2Q96PR1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNC2Q96PR1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNC2Q96PR1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNC2Q96PR1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNC2Q96PR1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNC2Q96PR1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
KCNC2Q96PR1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCNC2Q96PR1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNC2Q96PR1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNC2Q96PR1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNC2Q96PR1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNC2Q96PR1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNC2Q96PR1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNC2Q96PR1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNC2Q96PR1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNC2Q96PR1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNC2Q96PR1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNC2Q96PR1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNC2Q96PR1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNC2Q96PR1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNC2Q96PR1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNC2Q96PR1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNC2Q96PR1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNC2Q96PR1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNC2Q96PR1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNC2Q96PR1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNC2Q96PR1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNC2Q96PR1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNC2Q96PR1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNC2Q96PR1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNC2Q96PR1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNC2Q96PR1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNC2Q96PR1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNC2Q96PR1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNC2Q96PR1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNC2Q96PR1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNC2Q96PR1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNC2Q96PR1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNC2Q96PR1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNC2Q96PR1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNC2Q96PR1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNC2Q96PR1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNC2Q96PR1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNC2Q96PR1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNC2Q96PR1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNC2Q96PR1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNC2Q96PR1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNC2Q96PR1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNC2Q96PR1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNC2Q96PR1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNC2Q96PR1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNC2Q96PR1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNC2Q96PR1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNC2Q96PR1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNC2Q96PR1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNC2Q96PR1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KCNC2Q96PR1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
KCNC2Q96PR1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms