Protein–RNA interactions for Protein: Q96MP8

KCTD7, BTB/POZ domain-containing protein KCTD7, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD7Q96MP8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCTD7Q96MP8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCTD7Q96MP8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCTD7Q96MP8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCTD7Q96MP8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCTD7Q96MP8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCTD7Q96MP8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCTD7Q96MP8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCTD7Q96MP8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCTD7Q96MP8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KCTD7Q96MP8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KCTD7Q96MP8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCTD7Q96MP8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCTD7Q96MP8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCTD7Q96MP8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCTD7Q96MP8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCTD7Q96MP8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCTD7Q96MP8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCTD7Q96MP8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCTD7Q96MP8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCTD7Q96MP8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCTD7Q96MP8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCTD7Q96MP8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCTD7Q96MP8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCTD7Q96MP8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCTD7Q96MP8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCTD7Q96MP8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCTD7Q96MP8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCTD7Q96MP8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCTD7Q96MP8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCTD7Q96MP8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KCTD7Q96MP8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KCTD7Q96MP8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCTD7Q96MP8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
KCTD7Q96MP8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCTD7Q96MP8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCTD7Q96MP8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KCTD7Q96MP8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KCTD7Q96MP8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KCTD7Q96MP8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCTD7Q96MP8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCTD7Q96MP8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCTD7Q96MP8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCTD7Q96MP8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCTD7Q96MP8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCTD7Q96MP8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCTD7Q96MP8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCTD7Q96MP8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KCTD7Q96MP8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCTD7Q96MP8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
KCTD7Q96MP8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCTD7Q96MP8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCTD7Q96MP8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
KCTD7Q96MP8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KCTD7Q96MP8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCTD7Q96MP8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCTD7Q96MP8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCTD7Q96MP8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCTD7Q96MP8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCTD7Q96MP8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCTD7Q96MP8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCTD7Q96MP8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCTD7Q96MP8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCTD7Q96MP8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCTD7Q96MP8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCTD7Q96MP8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KCTD7Q96MP8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KCTD7Q96MP8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCTD7Q96MP8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KCTD7Q96MP8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KCTD7Q96MP8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCTD7Q96MP8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KCTD7Q96MP8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KCTD7Q96MP8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCTD7Q96MP8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCTD7Q96MP8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KCTD7Q96MP8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCTD7Q96MP8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCTD7Q96MP8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCTD7Q96MP8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCTD7Q96MP8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCTD7Q96MP8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCTD7Q96MP8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCTD7Q96MP8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KCTD7Q96MP8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCTD7Q96MP8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCTD7Q96MP8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCTD7Q96MP8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCTD7Q96MP8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCTD7Q96MP8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCTD7Q96MP8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCTD7Q96MP8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCTD7Q96MP8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCTD7Q96MP8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCTD7Q96MP8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCTD7Q96MP8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KCTD7Q96MP8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCTD7Q96MP8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCTD7Q96MP8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCTD7Q96MP8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms