Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CNBD2Q96M20 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNBD2Q96M20 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNBD2Q96M20 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNBD2Q96M20 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNBD2Q96M20 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNBD2Q96M20 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNBD2Q96M20 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNBD2Q96M20 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNBD2Q96M20 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNBD2Q96M20 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CNBD2Q96M20 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNBD2Q96M20 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNBD2Q96M20 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNBD2Q96M20 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNBD2Q96M20 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNBD2Q96M20 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNBD2Q96M20 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNBD2Q96M20 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNBD2Q96M20 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNBD2Q96M20 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNBD2Q96M20 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNBD2Q96M20 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNBD2Q96M20 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNBD2Q96M20 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNBD2Q96M20 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNBD2Q96M20 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNBD2Q96M20 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNBD2Q96M20 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNBD2Q96M20 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNBD2Q96M20 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNBD2Q96M20 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNBD2Q96M20 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNBD2Q96M20 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNBD2Q96M20 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNBD2Q96M20 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNBD2Q96M20 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNBD2Q96M20 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CNBD2Q96M20 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNBD2Q96M20 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNBD2Q96M20 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CNBD2Q96M20 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNBD2Q96M20 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNBD2Q96M20 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNBD2Q96M20 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CNBD2Q96M20 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNBD2Q96M20 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNBD2Q96M20 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNBD2Q96M20 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNBD2Q96M20 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNBD2Q96M20 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNBD2Q96M20 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNBD2Q96M20 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNBD2Q96M20 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNBD2Q96M20 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNBD2Q96M20 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNBD2Q96M20 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNBD2Q96M20 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNBD2Q96M20 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNBD2Q96M20 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNBD2Q96M20 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNBD2Q96M20 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNBD2Q96M20 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNBD2Q96M20 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNBD2Q96M20 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNBD2Q96M20 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNBD2Q96M20 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNBD2Q96M20 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNBD2Q96M20 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNBD2Q96M20 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNBD2Q96M20 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNBD2Q96M20 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNBD2Q96M20 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNBD2Q96M20 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNBD2Q96M20 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNBD2Q96M20 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNBD2Q96M20 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNBD2Q96M20 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNBD2Q96M20 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNBD2Q96M20 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNBD2Q96M20 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNBD2Q96M20 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNBD2Q96M20 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNBD2Q96M20 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNBD2Q96M20 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNBD2Q96M20 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNBD2Q96M20 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNBD2Q96M20 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNBD2Q96M20 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNBD2Q96M20 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNBD2Q96M20 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNBD2Q96M20 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNBD2Q96M20 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNBD2Q96M20 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNBD2Q96M20 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNBD2Q96M20 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNBD2Q96M20 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNBD2Q96M20 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CNBD2Q96M20 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNBD2Q96M20 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms