Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS9Q8WXC6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS9Q8WXC6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS9Q8WXC6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS9Q8WXC6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS9Q8WXC6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS9Q8WXC6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS9Q8WXC6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS9Q8WXC6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS9Q8WXC6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS9Q8WXC6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS9Q8WXC6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS9Q8WXC6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS9Q8WXC6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS9Q8WXC6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS9Q8WXC6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS9Q8WXC6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS9Q8WXC6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS9Q8WXC6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
COPS9Q8WXC6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COPS9Q8WXC6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COPS9Q8WXC6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
COPS9Q8WXC6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.5 ms