Protein–RNA interactions for Protein: Q8TA94

ZNF563, Zinc finger protein 563, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF563Q8TA94 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF563Q8TA94 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF563Q8TA94 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF563Q8TA94 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF563Q8TA94 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF563Q8TA94 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF563Q8TA94 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF563Q8TA94 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF563Q8TA94 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF563Q8TA94 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF563Q8TA94 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF563Q8TA94 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF563Q8TA94 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF563Q8TA94 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF563Q8TA94 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF563Q8TA94 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF563Q8TA94 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF563Q8TA94 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF563Q8TA94 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF563Q8TA94 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF563Q8TA94 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF563Q8TA94 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF563Q8TA94 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF563Q8TA94 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF563Q8TA94 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF563Q8TA94 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF563Q8TA94 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF563Q8TA94 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF563Q8TA94 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF563Q8TA94 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF563Q8TA94 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF563Q8TA94 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF563Q8TA94 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF563Q8TA94 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF563Q8TA94 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF563Q8TA94 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF563Q8TA94 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF563Q8TA94 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF563Q8TA94 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF563Q8TA94 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF563Q8TA94 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF563Q8TA94 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF563Q8TA94 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF563Q8TA94 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF563Q8TA94 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF563Q8TA94 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF563Q8TA94 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF563Q8TA94 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF563Q8TA94 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF563Q8TA94 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF563Q8TA94 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF563Q8TA94 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF563Q8TA94 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF563Q8TA94 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF563Q8TA94 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF563Q8TA94 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF563Q8TA94 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF563Q8TA94 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF563Q8TA94 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF563Q8TA94 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF563Q8TA94 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF563Q8TA94 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF563Q8TA94 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF563Q8TA94 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF563Q8TA94 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF563Q8TA94 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF563Q8TA94 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF563Q8TA94 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF563Q8TA94 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF563Q8TA94 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF563Q8TA94 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF563Q8TA94 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF563Q8TA94 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF563Q8TA94 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF563Q8TA94 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF563Q8TA94 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF563Q8TA94 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF563Q8TA94 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF563Q8TA94 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF563Q8TA94 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF563Q8TA94 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF563Q8TA94 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF563Q8TA94 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF563Q8TA94 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF563Q8TA94 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF563Q8TA94 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF563Q8TA94 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF563Q8TA94 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF563Q8TA94 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF563Q8TA94 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF563Q8TA94 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF563Q8TA94 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF563Q8TA94 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF563Q8TA94 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF563Q8TA94 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF563Q8TA94 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF563Q8TA94 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF563Q8TA94 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF563Q8TA94 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF563Q8TA94 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms