Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FSIP1Q8NA03 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FSIP1Q8NA03 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FSIP1Q8NA03 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FSIP1Q8NA03 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FSIP1Q8NA03 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FSIP1Q8NA03 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FSIP1Q8NA03 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FSIP1Q8NA03 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FSIP1Q8NA03 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FSIP1Q8NA03 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FSIP1Q8NA03 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FSIP1Q8NA03 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FSIP1Q8NA03 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
FSIP1Q8NA03 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FSIP1Q8NA03 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
FSIP1Q8NA03 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FSIP1Q8NA03 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FSIP1Q8NA03 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FSIP1Q8NA03 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FSIP1Q8NA03 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FSIP1Q8NA03 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FSIP1Q8NA03 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FSIP1Q8NA03 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FSIP1Q8NA03 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FSIP1Q8NA03 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FSIP1Q8NA03 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FSIP1Q8NA03 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FSIP1Q8NA03 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FSIP1Q8NA03 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FSIP1Q8NA03 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FSIP1Q8NA03 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FSIP1Q8NA03 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FSIP1Q8NA03 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FSIP1Q8NA03 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FSIP1Q8NA03 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
FSIP1Q8NA03 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FSIP1Q8NA03 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FSIP1Q8NA03 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FSIP1Q8NA03 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FSIP1Q8NA03 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FSIP1Q8NA03 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FSIP1Q8NA03 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FSIP1Q8NA03 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FSIP1Q8NA03 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FSIP1Q8NA03 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FSIP1Q8NA03 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FSIP1Q8NA03 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FSIP1Q8NA03 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FSIP1Q8NA03 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FSIP1Q8NA03 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FSIP1Q8NA03 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FSIP1Q8NA03 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FSIP1Q8NA03 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FSIP1Q8NA03 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
FSIP1Q8NA03 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FSIP1Q8NA03 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FSIP1Q8NA03 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FSIP1Q8NA03 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FSIP1Q8NA03 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FSIP1Q8NA03 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
FSIP1Q8NA03 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
FSIP1Q8NA03 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FSIP1Q8NA03 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FSIP1Q8NA03 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FSIP1Q8NA03 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FSIP1Q8NA03 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FSIP1Q8NA03 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FSIP1Q8NA03 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FSIP1Q8NA03 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FSIP1Q8NA03 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FSIP1Q8NA03 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FSIP1Q8NA03 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FSIP1Q8NA03 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FSIP1Q8NA03 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FSIP1Q8NA03 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FSIP1Q8NA03 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FSIP1Q8NA03 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FSIP1Q8NA03 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FSIP1Q8NA03 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
FSIP1Q8NA03 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FSIP1Q8NA03 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FSIP1Q8NA03 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FSIP1Q8NA03 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FSIP1Q8NA03 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FSIP1Q8NA03 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FSIP1Q8NA03 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
FSIP1Q8NA03 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FSIP1Q8NA03 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FSIP1Q8NA03 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FSIP1Q8NA03 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FSIP1Q8NA03 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
FSIP1Q8NA03 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FSIP1Q8NA03 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FSIP1Q8NA03 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FSIP1Q8NA03 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FSIP1Q8NA03 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FSIP1Q8NA03 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FSIP1Q8NA03 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FSIP1Q8NA03 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms