Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTL3Q8N8U3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RTL3Q8N8U3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTL3Q8N8U3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTL3Q8N8U3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTL3Q8N8U3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RTL3Q8N8U3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTL3Q8N8U3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTL3Q8N8U3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTL3Q8N8U3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTL3Q8N8U3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTL3Q8N8U3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTL3Q8N8U3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTL3Q8N8U3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RTL3Q8N8U3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RTL3Q8N8U3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RTL3Q8N8U3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTL3Q8N8U3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTL3Q8N8U3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTL3Q8N8U3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTL3Q8N8U3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTL3Q8N8U3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTL3Q8N8U3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RTL3Q8N8U3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTL3Q8N8U3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTL3Q8N8U3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTL3Q8N8U3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTL3Q8N8U3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTL3Q8N8U3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTL3Q8N8U3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTL3Q8N8U3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTL3Q8N8U3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTL3Q8N8U3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTL3Q8N8U3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTL3Q8N8U3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTL3Q8N8U3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTL3Q8N8U3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTL3Q8N8U3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTL3Q8N8U3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RTL3Q8N8U3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTL3Q8N8U3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RTL3Q8N8U3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RTL3Q8N8U3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTL3Q8N8U3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTL3Q8N8U3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTL3Q8N8U3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTL3Q8N8U3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTL3Q8N8U3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTL3Q8N8U3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTL3Q8N8U3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RTL3Q8N8U3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RTL3Q8N8U3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTL3Q8N8U3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTL3Q8N8U3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTL3Q8N8U3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTL3Q8N8U3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTL3Q8N8U3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RTL3Q8N8U3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTL3Q8N8U3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTL3Q8N8U3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTL3Q8N8U3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTL3Q8N8U3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTL3Q8N8U3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTL3Q8N8U3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTL3Q8N8U3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTL3Q8N8U3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTL3Q8N8U3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RTL3Q8N8U3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTL3Q8N8U3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RTL3Q8N8U3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTL3Q8N8U3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RTL3Q8N8U3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTL3Q8N8U3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTL3Q8N8U3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RTL3Q8N8U3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTL3Q8N8U3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTL3Q8N8U3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTL3Q8N8U3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTL3Q8N8U3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTL3Q8N8U3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTL3Q8N8U3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTL3Q8N8U3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTL3Q8N8U3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTL3Q8N8U3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTL3Q8N8U3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTL3Q8N8U3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTL3Q8N8U3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTL3Q8N8U3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTL3Q8N8U3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTL3Q8N8U3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTL3Q8N8U3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTL3Q8N8U3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTL3Q8N8U3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTL3Q8N8U3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTL3Q8N8U3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTL3Q8N8U3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTL3Q8N8U3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTL3Q8N8U3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTL3Q8N8U3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTL3Q8N8U3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms