Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms