Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC82Q8N4S0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC82Q8N4S0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC82Q8N4S0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC82Q8N4S0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC82Q8N4S0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC82Q8N4S0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC82Q8N4S0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC82Q8N4S0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC82Q8N4S0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC82Q8N4S0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC82Q8N4S0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC82Q8N4S0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC82Q8N4S0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC82Q8N4S0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC82Q8N4S0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC82Q8N4S0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC82Q8N4S0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC82Q8N4S0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC82Q8N4S0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC82Q8N4S0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC82Q8N4S0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC82Q8N4S0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC82Q8N4S0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC82Q8N4S0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC82Q8N4S0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC82Q8N4S0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC82Q8N4S0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC82Q8N4S0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC82Q8N4S0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC82Q8N4S0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC82Q8N4S0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC82Q8N4S0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC82Q8N4S0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC82Q8N4S0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC82Q8N4S0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC82Q8N4S0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC82Q8N4S0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC82Q8N4S0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC82Q8N4S0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC82Q8N4S0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC82Q8N4S0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC82Q8N4S0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC82Q8N4S0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC82Q8N4S0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC82Q8N4S0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC82Q8N4S0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC82Q8N4S0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC82Q8N4S0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC82Q8N4S0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC82Q8N4S0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC82Q8N4S0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC82Q8N4S0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC82Q8N4S0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC82Q8N4S0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC82Q8N4S0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC82Q8N4S0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC82Q8N4S0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC82Q8N4S0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC82Q8N4S0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC82Q8N4S0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC82Q8N4S0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC82Q8N4S0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC82Q8N4S0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC82Q8N4S0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC82Q8N4S0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC82Q8N4S0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC82Q8N4S0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC82Q8N4S0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC82Q8N4S0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC82Q8N4S0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC82Q8N4S0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC82Q8N4S0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC82Q8N4S0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC82Q8N4S0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC82Q8N4S0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC82Q8N4S0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC82Q8N4S0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC82Q8N4S0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
CCDC82Q8N4S0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CCDC82Q8N4S0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC82Q8N4S0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC82Q8N4S0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC82Q8N4S0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC82Q8N4S0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC82Q8N4S0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC82Q8N4S0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC82Q8N4S0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC82Q8N4S0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC82Q8N4S0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC82Q8N4S0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC82Q8N4S0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC82Q8N4S0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC82Q8N4S0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC82Q8N4S0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC82Q8N4S0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC82Q8N4S0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC82Q8N4S0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC82Q8N4S0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCDC82Q8N4S0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.4 ms