Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1Q1

CA13, Carbonic anhydrase 13, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA13Q8N1Q1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CA13Q8N1Q1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CA13Q8N1Q1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CA13Q8N1Q1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CA13Q8N1Q1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CA13Q8N1Q1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CA13Q8N1Q1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CA13Q8N1Q1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CA13Q8N1Q1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CA13Q8N1Q1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CA13Q8N1Q1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CA13Q8N1Q1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CA13Q8N1Q1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CA13Q8N1Q1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CA13Q8N1Q1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CA13Q8N1Q1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CA13Q8N1Q1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CA13Q8N1Q1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CA13Q8N1Q1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CA13Q8N1Q1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CA13Q8N1Q1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CA13Q8N1Q1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CA13Q8N1Q1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CA13Q8N1Q1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CA13Q8N1Q1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CA13Q8N1Q1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CA13Q8N1Q1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CA13Q8N1Q1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CA13Q8N1Q1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CA13Q8N1Q1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CA13Q8N1Q1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CA13Q8N1Q1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CA13Q8N1Q1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CA13Q8N1Q1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CA13Q8N1Q1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CA13Q8N1Q1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CA13Q8N1Q1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CA13Q8N1Q1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CA13Q8N1Q1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CA13Q8N1Q1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CA13Q8N1Q1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CA13Q8N1Q1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CA13Q8N1Q1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CA13Q8N1Q1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CA13Q8N1Q1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CA13Q8N1Q1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CA13Q8N1Q1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CA13Q8N1Q1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CA13Q8N1Q1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CA13Q8N1Q1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CA13Q8N1Q1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CA13Q8N1Q1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CA13Q8N1Q1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CA13Q8N1Q1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CA13Q8N1Q1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CA13Q8N1Q1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CA13Q8N1Q1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CA13Q8N1Q1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CA13Q8N1Q1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CA13Q8N1Q1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CA13Q8N1Q1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CA13Q8N1Q1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CA13Q8N1Q1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CA13Q8N1Q1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CA13Q8N1Q1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CA13Q8N1Q1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CA13Q8N1Q1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CA13Q8N1Q1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CA13Q8N1Q1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CA13Q8N1Q1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CA13Q8N1Q1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CA13Q8N1Q1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CA13Q8N1Q1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CA13Q8N1Q1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CA13Q8N1Q1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CA13Q8N1Q1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CA13Q8N1Q1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CA13Q8N1Q1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CA13Q8N1Q1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CA13Q8N1Q1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CA13Q8N1Q1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CA13Q8N1Q1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CA13Q8N1Q1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CA13Q8N1Q1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CA13Q8N1Q1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CA13Q8N1Q1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CA13Q8N1Q1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CA13Q8N1Q1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CA13Q8N1Q1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CA13Q8N1Q1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CA13Q8N1Q1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CA13Q8N1Q1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CA13Q8N1Q1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CA13Q8N1Q1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CA13Q8N1Q1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CA13Q8N1Q1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CA13Q8N1Q1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CA13Q8N1Q1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CA13Q8N1Q1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CA13Q8N1Q1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms