Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ73

RPUSD2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD2Q8IZ73 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPUSD2Q8IZ73 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPUSD2Q8IZ73 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPUSD2Q8IZ73 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPUSD2Q8IZ73 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPUSD2Q8IZ73 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RPUSD2Q8IZ73 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPUSD2Q8IZ73 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPUSD2Q8IZ73 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPUSD2Q8IZ73 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPUSD2Q8IZ73 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPUSD2Q8IZ73 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPUSD2Q8IZ73 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPUSD2Q8IZ73 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPUSD2Q8IZ73 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPUSD2Q8IZ73 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPUSD2Q8IZ73 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPUSD2Q8IZ73 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPUSD2Q8IZ73 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPUSD2Q8IZ73 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPUSD2Q8IZ73 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPUSD2Q8IZ73 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPUSD2Q8IZ73 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPUSD2Q8IZ73 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPUSD2Q8IZ73 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPUSD2Q8IZ73 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPUSD2Q8IZ73 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RPUSD2Q8IZ73 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
RPUSD2Q8IZ73 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPUSD2Q8IZ73 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPUSD2Q8IZ73 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPUSD2Q8IZ73 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RPUSD2Q8IZ73 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPUSD2Q8IZ73 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPUSD2Q8IZ73 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPUSD2Q8IZ73 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPUSD2Q8IZ73 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPUSD2Q8IZ73 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPUSD2Q8IZ73 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPUSD2Q8IZ73 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPUSD2Q8IZ73 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPUSD2Q8IZ73 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPUSD2Q8IZ73 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPUSD2Q8IZ73 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPUSD2Q8IZ73 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPUSD2Q8IZ73 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RPUSD2Q8IZ73 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPUSD2Q8IZ73 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPUSD2Q8IZ73 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPUSD2Q8IZ73 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPUSD2Q8IZ73 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPUSD2Q8IZ73 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPUSD2Q8IZ73 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPUSD2Q8IZ73 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPUSD2Q8IZ73 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RPUSD2Q8IZ73 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPUSD2Q8IZ73 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPUSD2Q8IZ73 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPUSD2Q8IZ73 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPUSD2Q8IZ73 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPUSD2Q8IZ73 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPUSD2Q8IZ73 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPUSD2Q8IZ73 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPUSD2Q8IZ73 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPUSD2Q8IZ73 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RPUSD2Q8IZ73 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPUSD2Q8IZ73 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPUSD2Q8IZ73 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RPUSD2Q8IZ73 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RPUSD2Q8IZ73 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RPUSD2Q8IZ73 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPUSD2Q8IZ73 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPUSD2Q8IZ73 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPUSD2Q8IZ73 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RPUSD2Q8IZ73 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPUSD2Q8IZ73 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPUSD2Q8IZ73 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPUSD2Q8IZ73 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPUSD2Q8IZ73 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPUSD2Q8IZ73 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPUSD2Q8IZ73 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RPUSD2Q8IZ73 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPUSD2Q8IZ73 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPUSD2Q8IZ73 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPUSD2Q8IZ73 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPUSD2Q8IZ73 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPUSD2Q8IZ73 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPUSD2Q8IZ73 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPUSD2Q8IZ73 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPUSD2Q8IZ73 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPUSD2Q8IZ73 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPUSD2Q8IZ73 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RPUSD2Q8IZ73 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPUSD2Q8IZ73 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RPUSD2Q8IZ73 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RPUSD2Q8IZ73 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RPUSD2Q8IZ73 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RPUSD2Q8IZ73 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RPUSD2Q8IZ73 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RPUSD2Q8IZ73 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms