Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RPAP2Q8IXW5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RPAP2Q8IXW5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RPAP2Q8IXW5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RPAP2Q8IXW5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RPAP2Q8IXW5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RPAP2Q8IXW5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RPAP2Q8IXW5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RPAP2Q8IXW5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RPAP2Q8IXW5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RPAP2Q8IXW5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RPAP2Q8IXW5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
RPAP2Q8IXW5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RPAP2Q8IXW5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RPAP2Q8IXW5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RPAP2Q8IXW5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RPAP2Q8IXW5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RPAP2Q8IXW5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RPAP2Q8IXW5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RPAP2Q8IXW5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RPAP2Q8IXW5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RPAP2Q8IXW5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RPAP2Q8IXW5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RPAP2Q8IXW5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RPAP2Q8IXW5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RPAP2Q8IXW5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RPAP2Q8IXW5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
RPAP2Q8IXW5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
RPAP2Q8IXW5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RPAP2Q8IXW5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RPAP2Q8IXW5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RPAP2Q8IXW5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RPAP2Q8IXW5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RPAP2Q8IXW5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RPAP2Q8IXW5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RPAP2Q8IXW5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RPAP2Q8IXW5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RPAP2Q8IXW5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RPAP2Q8IXW5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RPAP2Q8IXW5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RPAP2Q8IXW5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RPAP2Q8IXW5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RPAP2Q8IXW5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RPAP2Q8IXW5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RPAP2Q8IXW5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RPAP2Q8IXW5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
RPAP2Q8IXW5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RPAP2Q8IXW5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RPAP2Q8IXW5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RPAP2Q8IXW5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RPAP2Q8IXW5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
RPAP2Q8IXW5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RPAP2Q8IXW5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RPAP2Q8IXW5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RPAP2Q8IXW5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RPAP2Q8IXW5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RPAP2Q8IXW5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RPAP2Q8IXW5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
RPAP2Q8IXW5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RPAP2Q8IXW5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RPAP2Q8IXW5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RPAP2Q8IXW5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RPAP2Q8IXW5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RPAP2Q8IXW5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RPAP2Q8IXW5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RPAP2Q8IXW5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
RPAP2Q8IXW5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RPAP2Q8IXW5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RPAP2Q8IXW5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RPAP2Q8IXW5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RPAP2Q8IXW5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RPAP2Q8IXW5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RPAP2Q8IXW5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RPAP2Q8IXW5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RPAP2Q8IXW5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RPAP2Q8IXW5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RPAP2Q8IXW5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RPAP2Q8IXW5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RPAP2Q8IXW5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RPAP2Q8IXW5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RPAP2Q8IXW5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RPAP2Q8IXW5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RPAP2Q8IXW5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RPAP2Q8IXW5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RPAP2Q8IXW5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RPAP2Q8IXW5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RPAP2Q8IXW5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RPAP2Q8IXW5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RPAP2Q8IXW5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
RPAP2Q8IXW5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RPAP2Q8IXW5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RPAP2Q8IXW5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RPAP2Q8IXW5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RPAP2Q8IXW5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RPAP2Q8IXW5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RPAP2Q8IXW5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RPAP2Q8IXW5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RPAP2Q8IXW5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RPAP2Q8IXW5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RPAP2Q8IXW5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms