Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXS2

CCDC65, Coiled-coil domain-containing protein 65, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC65Q8IXS2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC65Q8IXS2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC65Q8IXS2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC65Q8IXS2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC65Q8IXS2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC65Q8IXS2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC65Q8IXS2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC65Q8IXS2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC65Q8IXS2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC65Q8IXS2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC65Q8IXS2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC65Q8IXS2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC65Q8IXS2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC65Q8IXS2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC65Q8IXS2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC65Q8IXS2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC65Q8IXS2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC65Q8IXS2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC65Q8IXS2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC65Q8IXS2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC65Q8IXS2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC65Q8IXS2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC65Q8IXS2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC65Q8IXS2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC65Q8IXS2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC65Q8IXS2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC65Q8IXS2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC65Q8IXS2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC65Q8IXS2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC65Q8IXS2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC65Q8IXS2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC65Q8IXS2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC65Q8IXS2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC65Q8IXS2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC65Q8IXS2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC65Q8IXS2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC65Q8IXS2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC65Q8IXS2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC65Q8IXS2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC65Q8IXS2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC65Q8IXS2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC65Q8IXS2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC65Q8IXS2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC65Q8IXS2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC65Q8IXS2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC65Q8IXS2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC65Q8IXS2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC65Q8IXS2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC65Q8IXS2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC65Q8IXS2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC65Q8IXS2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC65Q8IXS2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC65Q8IXS2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC65Q8IXS2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC65Q8IXS2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC65Q8IXS2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC65Q8IXS2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC65Q8IXS2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC65Q8IXS2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC65Q8IXS2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC65Q8IXS2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC65Q8IXS2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC65Q8IXS2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC65Q8IXS2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC65Q8IXS2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC65Q8IXS2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CCDC65Q8IXS2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC65Q8IXS2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC65Q8IXS2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC65Q8IXS2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC65Q8IXS2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC65Q8IXS2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC65Q8IXS2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC65Q8IXS2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC65Q8IXS2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC65Q8IXS2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC65Q8IXS2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC65Q8IXS2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC65Q8IXS2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC65Q8IXS2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC65Q8IXS2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC65Q8IXS2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC65Q8IXS2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC65Q8IXS2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC65Q8IXS2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC65Q8IXS2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC65Q8IXS2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC65Q8IXS2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC65Q8IXS2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC65Q8IXS2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC65Q8IXS2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC65Q8IXS2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC65Q8IXS2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC65Q8IXS2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC65Q8IXS2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC65Q8IXS2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC65Q8IXS2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC65Q8IXS2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC65Q8IXS2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC65Q8IXS2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms