Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf40Q8IXQ3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf40Q8IXQ3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf40Q8IXQ3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf40Q8IXQ3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf40Q8IXQ3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf40Q8IXQ3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf40Q8IXQ3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf40Q8IXQ3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
C9orf40Q8IXQ3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf40Q8IXQ3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf40Q8IXQ3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf40Q8IXQ3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf40Q8IXQ3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf40Q8IXQ3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf40Q8IXQ3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf40Q8IXQ3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf40Q8IXQ3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf40Q8IXQ3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf40Q8IXQ3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf40Q8IXQ3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf40Q8IXQ3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf40Q8IXQ3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf40Q8IXQ3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf40Q8IXQ3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf40Q8IXQ3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf40Q8IXQ3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf40Q8IXQ3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf40Q8IXQ3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf40Q8IXQ3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf40Q8IXQ3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf40Q8IXQ3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf40Q8IXQ3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf40Q8IXQ3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf40Q8IXQ3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf40Q8IXQ3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf40Q8IXQ3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf40Q8IXQ3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf40Q8IXQ3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf40Q8IXQ3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf40Q8IXQ3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf40Q8IXQ3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf40Q8IXQ3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf40Q8IXQ3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf40Q8IXQ3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf40Q8IXQ3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf40Q8IXQ3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf40Q8IXQ3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C9orf40Q8IXQ3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf40Q8IXQ3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf40Q8IXQ3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf40Q8IXQ3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf40Q8IXQ3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf40Q8IXQ3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf40Q8IXQ3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf40Q8IXQ3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf40Q8IXQ3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf40Q8IXQ3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf40Q8IXQ3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf40Q8IXQ3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf40Q8IXQ3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf40Q8IXQ3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf40Q8IXQ3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf40Q8IXQ3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf40Q8IXQ3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf40Q8IXQ3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf40Q8IXQ3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf40Q8IXQ3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf40Q8IXQ3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf40Q8IXQ3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf40Q8IXQ3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf40Q8IXQ3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf40Q8IXQ3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf40Q8IXQ3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf40Q8IXQ3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf40Q8IXQ3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf40Q8IXQ3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf40Q8IXQ3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf40Q8IXQ3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf40Q8IXQ3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf40Q8IXQ3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf40Q8IXQ3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf40Q8IXQ3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf40Q8IXQ3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf40Q8IXQ3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf40Q8IXQ3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf40Q8IXQ3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf40Q8IXQ3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf40Q8IXQ3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf40Q8IXQ3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf40Q8IXQ3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf40Q8IXQ3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf40Q8IXQ3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C9orf40Q8IXQ3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C9orf40Q8IXQ3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf40Q8IXQ3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf40Q8IXQ3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf40Q8IXQ3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf40Q8IXQ3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf40Q8IXQ3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms