Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWX8

CHERP, Calcium homeostasis endoplasmic reticulum protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHERPQ8IWX8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHERPQ8IWX8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHERPQ8IWX8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHERPQ8IWX8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CHERPQ8IWX8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHERPQ8IWX8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHERPQ8IWX8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHERPQ8IWX8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHERPQ8IWX8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHERPQ8IWX8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHERPQ8IWX8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHERPQ8IWX8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHERPQ8IWX8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHERPQ8IWX8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHERPQ8IWX8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHERPQ8IWX8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHERPQ8IWX8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHERPQ8IWX8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CHERPQ8IWX8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHERPQ8IWX8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHERPQ8IWX8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHERPQ8IWX8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHERPQ8IWX8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHERPQ8IWX8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHERPQ8IWX8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHERPQ8IWX8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHERPQ8IWX8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHERPQ8IWX8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHERPQ8IWX8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHERPQ8IWX8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CHERPQ8IWX8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CHERPQ8IWX8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHERPQ8IWX8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHERPQ8IWX8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHERPQ8IWX8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHERPQ8IWX8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHERPQ8IWX8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHERPQ8IWX8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHERPQ8IWX8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHERPQ8IWX8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHERPQ8IWX8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHERPQ8IWX8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHERPQ8IWX8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHERPQ8IWX8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHERPQ8IWX8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHERPQ8IWX8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms