Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC83Q8IWF9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC83Q8IWF9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC83Q8IWF9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC83Q8IWF9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC83Q8IWF9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC83Q8IWF9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC83Q8IWF9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC83Q8IWF9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC83Q8IWF9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC83Q8IWF9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC83Q8IWF9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC83Q8IWF9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC83Q8IWF9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC83Q8IWF9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC83Q8IWF9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC83Q8IWF9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC83Q8IWF9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC83Q8IWF9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC83Q8IWF9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC83Q8IWF9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC83Q8IWF9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC83Q8IWF9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC83Q8IWF9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC83Q8IWF9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC83Q8IWF9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC83Q8IWF9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC83Q8IWF9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC83Q8IWF9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC83Q8IWF9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC83Q8IWF9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC83Q8IWF9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC83Q8IWF9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC83Q8IWF9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC83Q8IWF9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC83Q8IWF9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC83Q8IWF9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC83Q8IWF9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC83Q8IWF9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC83Q8IWF9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC83Q8IWF9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC83Q8IWF9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC83Q8IWF9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC83Q8IWF9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC83Q8IWF9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC83Q8IWF9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC83Q8IWF9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC83Q8IWF9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC83Q8IWF9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC83Q8IWF9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC83Q8IWF9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC83Q8IWF9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC83Q8IWF9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC83Q8IWF9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC83Q8IWF9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC83Q8IWF9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC83Q8IWF9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC83Q8IWF9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC83Q8IWF9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC83Q8IWF9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC83Q8IWF9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC83Q8IWF9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC83Q8IWF9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC83Q8IWF9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC83Q8IWF9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC83Q8IWF9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC83Q8IWF9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC83Q8IWF9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC83Q8IWF9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC83Q8IWF9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC83Q8IWF9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC83Q8IWF9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC83Q8IWF9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC83Q8IWF9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC83Q8IWF9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC83Q8IWF9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC83Q8IWF9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC83Q8IWF9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC83Q8IWF9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC83Q8IWF9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC83Q8IWF9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC83Q8IWF9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC83Q8IWF9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC83Q8IWF9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC83Q8IWF9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC83Q8IWF9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC83Q8IWF9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC83Q8IWF9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC83Q8IWF9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC83Q8IWF9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC83Q8IWF9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC83Q8IWF9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC83Q8IWF9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC83Q8IWF9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC83Q8IWF9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC83Q8IWF9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC83Q8IWF9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CCDC83Q8IWF9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC83Q8IWF9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC83Q8IWF9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms