Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZD4Q76G19 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZD4Q76G19 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZD4Q76G19 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZD4Q76G19 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PDZD4Q76G19 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDZD4Q76G19 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDZD4Q76G19 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDZD4Q76G19 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDZD4Q76G19 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDZD4Q76G19 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDZD4Q76G19 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDZD4Q76G19 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZD4Q76G19 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZD4Q76G19 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZD4Q76G19 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZD4Q76G19 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZD4Q76G19 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZD4Q76G19 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZD4Q76G19 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZD4Q76G19 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDZD4Q76G19 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDZD4Q76G19 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDZD4Q76G19 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDZD4Q76G19 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDZD4Q76G19 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDZD4Q76G19 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDZD4Q76G19 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDZD4Q76G19 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDZD4Q76G19 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDZD4Q76G19 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDZD4Q76G19 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDZD4Q76G19 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDZD4Q76G19 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDZD4Q76G19 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDZD4Q76G19 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDZD4Q76G19 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDZD4Q76G19 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDZD4Q76G19 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDZD4Q76G19 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDZD4Q76G19 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDZD4Q76G19 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDZD4Q76G19 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDZD4Q76G19 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDZD4Q76G19 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDZD4Q76G19 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PDZD4Q76G19 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDZD4Q76G19 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDZD4Q76G19 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDZD4Q76G19 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDZD4Q76G19 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDZD4Q76G19 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDZD4Q76G19 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PDZD4Q76G19 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDZD4Q76G19 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDZD4Q76G19 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDZD4Q76G19 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDZD4Q76G19 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDZD4Q76G19 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDZD4Q76G19 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDZD4Q76G19 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDZD4Q76G19 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDZD4Q76G19 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDZD4Q76G19 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDZD4Q76G19 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDZD4Q76G19 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDZD4Q76G19 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDZD4Q76G19 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDZD4Q76G19 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDZD4Q76G19 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDZD4Q76G19 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDZD4Q76G19 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDZD4Q76G19 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDZD4Q76G19 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDZD4Q76G19 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDZD4Q76G19 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDZD4Q76G19 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDZD4Q76G19 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDZD4Q76G19 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PDZD4Q76G19 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDZD4Q76G19 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PDZD4Q76G19 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDZD4Q76G19 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDZD4Q76G19 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZD4Q76G19 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZD4Q76G19 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZD4Q76G19 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZD4Q76G19 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZD4Q76G19 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZD4Q76G19 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZD4Q76G19 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZD4Q76G19 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZD4Q76G19 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZD4Q76G19 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDZD4Q76G19 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PDZD4Q76G19 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDZD4Q76G19 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDZD4Q76G19 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDZD4Q76G19 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDZD4Q76G19 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms