Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXC1

MAMDC4, Apical endosomal glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAMDC4Q6UXC1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MAMDC4Q6UXC1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MAMDC4Q6UXC1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MAMDC4Q6UXC1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MAMDC4Q6UXC1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
MAMDC4Q6UXC1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
MAMDC4Q6UXC1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
MAMDC4Q6UXC1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MAMDC4Q6UXC1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MAMDC4Q6UXC1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MAMDC4Q6UXC1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MAMDC4Q6UXC1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MAMDC4Q6UXC1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MAMDC4Q6UXC1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
MAMDC4Q6UXC1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MAMDC4Q6UXC1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
MAMDC4Q6UXC1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MAMDC4Q6UXC1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MAMDC4Q6UXC1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MAMDC4Q6UXC1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.55■■■□□ 2
MAMDC4Q6UXC1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MAMDC4Q6UXC1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MAMDC4Q6UXC1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MAMDC4Q6UXC1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.54■■■□□ 2
MAMDC4Q6UXC1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MAMDC4Q6UXC1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MAMDC4Q6UXC1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MAMDC4Q6UXC1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MAMDC4Q6UXC1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MAMDC4Q6UXC1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MAMDC4Q6UXC1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MAMDC4Q6UXC1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MAMDC4Q6UXC1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.52■■■□□ 2
MAMDC4Q6UXC1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.52■■■□□ 2
MAMDC4Q6UXC1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MAMDC4Q6UXC1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
MAMDC4Q6UXC1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
MAMDC4Q6UXC1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MAMDC4Q6UXC1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MAMDC4Q6UXC1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
MAMDC4Q6UXC1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MAMDC4Q6UXC1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MAMDC4Q6UXC1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MAMDC4Q6UXC1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MAMDC4Q6UXC1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MAMDC4Q6UXC1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MAMDC4Q6UXC1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MAMDC4Q6UXC1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MAMDC4Q6UXC1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MAMDC4Q6UXC1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MAMDC4Q6UXC1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MAMDC4Q6UXC1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MAMDC4Q6UXC1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MAMDC4Q6UXC1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
MAMDC4Q6UXC1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MAMDC4Q6UXC1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MAMDC4Q6UXC1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MAMDC4Q6UXC1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MAMDC4Q6UXC1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MAMDC4Q6UXC1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MAMDC4Q6UXC1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MAMDC4Q6UXC1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MAMDC4Q6UXC1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MAMDC4Q6UXC1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MAMDC4Q6UXC1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MAMDC4Q6UXC1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MAMDC4Q6UXC1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MAMDC4Q6UXC1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MAMDC4Q6UXC1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MAMDC4Q6UXC1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MAMDC4Q6UXC1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MAMDC4Q6UXC1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MAMDC4Q6UXC1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MAMDC4Q6UXC1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MAMDC4Q6UXC1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MAMDC4Q6UXC1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MAMDC4Q6UXC1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MAMDC4Q6UXC1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MAMDC4Q6UXC1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MAMDC4Q6UXC1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MAMDC4Q6UXC1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MAMDC4Q6UXC1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MAMDC4Q6UXC1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MAMDC4Q6UXC1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MAMDC4Q6UXC1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MAMDC4Q6UXC1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MAMDC4Q6UXC1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MAMDC4Q6UXC1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MAMDC4Q6UXC1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MAMDC4Q6UXC1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MAMDC4Q6UXC1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MAMDC4Q6UXC1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MAMDC4Q6UXC1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MAMDC4Q6UXC1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MAMDC4Q6UXC1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MAMDC4Q6UXC1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MAMDC4Q6UXC1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MAMDC4Q6UXC1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
MAMDC4Q6UXC1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MAMDC4Q6UXC1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms