Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3F3CQ6NXT2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3F3CQ6NXT2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3F3CQ6NXT2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3F3CQ6NXT2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3F3CQ6NXT2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3F3CQ6NXT2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3F3CQ6NXT2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3F3CQ6NXT2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H3F3CQ6NXT2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
H3F3CQ6NXT2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3F3CQ6NXT2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3F3CQ6NXT2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3F3CQ6NXT2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3F3CQ6NXT2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3F3CQ6NXT2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3F3CQ6NXT2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
H3F3CQ6NXT2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3F3CQ6NXT2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3F3CQ6NXT2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3F3CQ6NXT2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3F3CQ6NXT2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3F3CQ6NXT2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
H3F3CQ6NXT2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
H3F3CQ6NXT2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3F3CQ6NXT2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3F3CQ6NXT2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3F3CQ6NXT2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3F3CQ6NXT2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3F3CQ6NXT2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3F3CQ6NXT2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3F3CQ6NXT2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3F3CQ6NXT2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3F3CQ6NXT2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3F3CQ6NXT2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
H3F3CQ6NXT2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3F3CQ6NXT2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3F3CQ6NXT2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
H3F3CQ6NXT2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3F3CQ6NXT2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3F3CQ6NXT2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3F3CQ6NXT2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3F3CQ6NXT2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3F3CQ6NXT2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3F3CQ6NXT2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
H3F3CQ6NXT2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3F3CQ6NXT2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3F3CQ6NXT2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
H3F3CQ6NXT2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3F3CQ6NXT2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3F3CQ6NXT2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3F3CQ6NXT2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3F3CQ6NXT2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3F3CQ6NXT2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H3F3CQ6NXT2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H3F3CQ6NXT2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H3F3CQ6NXT2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H3F3CQ6NXT2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H3F3CQ6NXT2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
H3F3CQ6NXT2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H3F3CQ6NXT2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H3F3CQ6NXT2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
H3F3CQ6NXT2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H3F3CQ6NXT2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H3F3CQ6NXT2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3F3CQ6NXT2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3F3CQ6NXT2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H3F3CQ6NXT2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3F3CQ6NXT2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3F3CQ6NXT2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3F3CQ6NXT2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3F3CQ6NXT2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3F3CQ6NXT2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3F3CQ6NXT2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3F3CQ6NXT2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3F3CQ6NXT2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3F3CQ6NXT2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3F3CQ6NXT2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
H3F3CQ6NXT2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
H3F3CQ6NXT2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3F3CQ6NXT2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
H3F3CQ6NXT2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3F3CQ6NXT2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3F3CQ6NXT2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3F3CQ6NXT2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
H3F3CQ6NXT2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3F3CQ6NXT2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3F3CQ6NXT2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3F3CQ6NXT2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
H3F3CQ6NXT2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3F3CQ6NXT2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3F3CQ6NXT2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3F3CQ6NXT2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3F3CQ6NXT2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3F3CQ6NXT2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3F3CQ6NXT2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3F3CQ6NXT2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3F3CQ6NXT2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3F3CQ6NXT2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3F3CQ6NXT2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms