Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT16

SLC18B1, MFS-type transporter SLC18B1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18B1Q6NT16 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC18B1Q6NT16 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC18B1Q6NT16 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC18B1Q6NT16 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC18B1Q6NT16 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC18B1Q6NT16 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC18B1Q6NT16 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC18B1Q6NT16 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC18B1Q6NT16 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC18B1Q6NT16 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC18B1Q6NT16 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC18B1Q6NT16 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC18B1Q6NT16 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC18B1Q6NT16 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC18B1Q6NT16 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC18B1Q6NT16 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC18B1Q6NT16 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC18B1Q6NT16 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC18B1Q6NT16 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC18B1Q6NT16 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC18B1Q6NT16 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC18B1Q6NT16 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC18B1Q6NT16 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC18B1Q6NT16 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC18B1Q6NT16 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC18B1Q6NT16 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC18B1Q6NT16 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC18B1Q6NT16 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC18B1Q6NT16 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC18B1Q6NT16 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC18B1Q6NT16 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC18B1Q6NT16 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC18B1Q6NT16 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC18B1Q6NT16 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC18B1Q6NT16 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC18B1Q6NT16 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC18B1Q6NT16 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC18B1Q6NT16 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC18B1Q6NT16 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC18B1Q6NT16 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC18B1Q6NT16 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC18B1Q6NT16 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC18B1Q6NT16 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC18B1Q6NT16 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC18B1Q6NT16 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC18B1Q6NT16 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC18B1Q6NT16 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC18B1Q6NT16 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC18B1Q6NT16 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms