Protein–RNA interactions for Protein: Q5XKE5

KRT79, Keratin, type II cytoskeletal 79, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT79Q5XKE5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT79Q5XKE5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT79Q5XKE5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT79Q5XKE5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT79Q5XKE5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT79Q5XKE5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT79Q5XKE5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT79Q5XKE5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT79Q5XKE5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT79Q5XKE5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT79Q5XKE5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT79Q5XKE5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT79Q5XKE5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT79Q5XKE5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT79Q5XKE5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT79Q5XKE5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT79Q5XKE5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT79Q5XKE5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT79Q5XKE5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT79Q5XKE5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT79Q5XKE5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT79Q5XKE5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT79Q5XKE5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT79Q5XKE5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT79Q5XKE5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
KRT79Q5XKE5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT79Q5XKE5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT79Q5XKE5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT79Q5XKE5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT79Q5XKE5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT79Q5XKE5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT79Q5XKE5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT79Q5XKE5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT79Q5XKE5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT79Q5XKE5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT79Q5XKE5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT79Q5XKE5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT79Q5XKE5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT79Q5XKE5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT79Q5XKE5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT79Q5XKE5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT79Q5XKE5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT79Q5XKE5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT79Q5XKE5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT79Q5XKE5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT79Q5XKE5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT79Q5XKE5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT79Q5XKE5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT79Q5XKE5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT79Q5XKE5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT79Q5XKE5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT79Q5XKE5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT79Q5XKE5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT79Q5XKE5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT79Q5XKE5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KRT79Q5XKE5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KRT79Q5XKE5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KRT79Q5XKE5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KRT79Q5XKE5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT79Q5XKE5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT79Q5XKE5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT79Q5XKE5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT79Q5XKE5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT79Q5XKE5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT79Q5XKE5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT79Q5XKE5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT79Q5XKE5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT79Q5XKE5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT79Q5XKE5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT79Q5XKE5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT79Q5XKE5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT79Q5XKE5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT79Q5XKE5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT79Q5XKE5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT79Q5XKE5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT79Q5XKE5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT79Q5XKE5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT79Q5XKE5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT79Q5XKE5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT79Q5XKE5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT79Q5XKE5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT79Q5XKE5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT79Q5XKE5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT79Q5XKE5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT79Q5XKE5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT79Q5XKE5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT79Q5XKE5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT79Q5XKE5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT79Q5XKE5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT79Q5XKE5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT79Q5XKE5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT79Q5XKE5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT79Q5XKE5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT79Q5XKE5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT79Q5XKE5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT79Q5XKE5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT79Q5XKE5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT79Q5XKE5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT79Q5XKE5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT79Q5XKE5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms