Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZK1Q5T2W1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZK1Q5T2W1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZK1Q5T2W1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZK1Q5T2W1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZK1Q5T2W1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZK1Q5T2W1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZK1Q5T2W1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZK1Q5T2W1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZK1Q5T2W1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZK1Q5T2W1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZK1Q5T2W1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZK1Q5T2W1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZK1Q5T2W1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZK1Q5T2W1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZK1Q5T2W1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZK1Q5T2W1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZK1Q5T2W1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDZK1Q5T2W1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDZK1Q5T2W1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZK1Q5T2W1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZK1Q5T2W1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZK1Q5T2W1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZK1Q5T2W1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZK1Q5T2W1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZK1Q5T2W1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZK1Q5T2W1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZK1Q5T2W1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZK1Q5T2W1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDZK1Q5T2W1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDZK1Q5T2W1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDZK1Q5T2W1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDZK1Q5T2W1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDZK1Q5T2W1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZK1Q5T2W1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZK1Q5T2W1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZK1Q5T2W1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZK1Q5T2W1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZK1Q5T2W1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZK1Q5T2W1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZK1Q5T2W1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZK1Q5T2W1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZK1Q5T2W1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZK1Q5T2W1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZK1Q5T2W1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZK1Q5T2W1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZK1Q5T2W1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZK1Q5T2W1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZK1Q5T2W1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZK1Q5T2W1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZK1Q5T2W1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZK1Q5T2W1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZK1Q5T2W1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZK1Q5T2W1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZK1Q5T2W1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZK1Q5T2W1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZK1Q5T2W1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZK1Q5T2W1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZK1Q5T2W1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZK1Q5T2W1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZK1Q5T2W1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZK1Q5T2W1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZK1Q5T2W1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZK1Q5T2W1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZK1Q5T2W1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDZK1Q5T2W1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDZK1Q5T2W1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PDZK1Q5T2W1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDZK1Q5T2W1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDZK1Q5T2W1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDZK1Q5T2W1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZK1Q5T2W1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZK1Q5T2W1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZK1Q5T2W1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZK1Q5T2W1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZK1Q5T2W1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZK1Q5T2W1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZK1Q5T2W1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZK1Q5T2W1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZK1Q5T2W1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZK1Q5T2W1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZK1Q5T2W1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZK1Q5T2W1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZK1Q5T2W1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZK1Q5T2W1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZK1Q5T2W1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZK1Q5T2W1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZK1Q5T2W1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZK1Q5T2W1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZK1Q5T2W1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZK1Q5T2W1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZK1Q5T2W1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZK1Q5T2W1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZK1Q5T2W1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZK1Q5T2W1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZK1Q5T2W1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDZK1Q5T2W1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDZK1Q5T2W1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDZK1Q5T2W1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDZK1Q5T2W1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms