Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD0

WASHC2D, WASH complex subunit 2D, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2DQ5SRD0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
WASHC2DQ5SRD0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
WASHC2DQ5SRD0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
WASHC2DQ5SRD0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WASHC2DQ5SRD0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WASHC2DQ5SRD0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
WASHC2DQ5SRD0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
WASHC2DQ5SRD0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
WASHC2DQ5SRD0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
WASHC2DQ5SRD0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
WASHC2DQ5SRD0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
WASHC2DQ5SRD0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
WASHC2DQ5SRD0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
WASHC2DQ5SRD0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
WASHC2DQ5SRD0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
WASHC2DQ5SRD0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
WASHC2DQ5SRD0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
WASHC2DQ5SRD0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
WASHC2DQ5SRD0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
WASHC2DQ5SRD0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
WASHC2DQ5SRD0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
WASHC2DQ5SRD0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
WASHC2DQ5SRD0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
WASHC2DQ5SRD0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
WASHC2DQ5SRD0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
WASHC2DQ5SRD0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
WASHC2DQ5SRD0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
WASHC2DQ5SRD0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
WASHC2DQ5SRD0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
WASHC2DQ5SRD0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
WASHC2DQ5SRD0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
WASHC2DQ5SRD0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
WASHC2DQ5SRD0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
WASHC2DQ5SRD0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
WASHC2DQ5SRD0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
WASHC2DQ5SRD0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
WASHC2DQ5SRD0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
WASHC2DQ5SRD0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
WASHC2DQ5SRD0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
WASHC2DQ5SRD0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
WASHC2DQ5SRD0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
WASHC2DQ5SRD0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
WASHC2DQ5SRD0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
WASHC2DQ5SRD0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
WASHC2DQ5SRD0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
WASHC2DQ5SRD0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
WASHC2DQ5SRD0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
WASHC2DQ5SRD0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
WASHC2DQ5SRD0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
WASHC2DQ5SRD0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
WASHC2DQ5SRD0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
WASHC2DQ5SRD0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
WASHC2DQ5SRD0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
WASHC2DQ5SRD0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
WASHC2DQ5SRD0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
WASHC2DQ5SRD0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
WASHC2DQ5SRD0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
WASHC2DQ5SRD0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
WASHC2DQ5SRD0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
WASHC2DQ5SRD0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
WASHC2DQ5SRD0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
WASHC2DQ5SRD0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
WASHC2DQ5SRD0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
WASHC2DQ5SRD0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
WASHC2DQ5SRD0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
WASHC2DQ5SRD0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
WASHC2DQ5SRD0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
WASHC2DQ5SRD0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
WASHC2DQ5SRD0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
WASHC2DQ5SRD0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
WASHC2DQ5SRD0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
WASHC2DQ5SRD0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
WASHC2DQ5SRD0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
WASHC2DQ5SRD0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
WASHC2DQ5SRD0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
WASHC2DQ5SRD0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
WASHC2DQ5SRD0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
WASHC2DQ5SRD0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
WASHC2DQ5SRD0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
WASHC2DQ5SRD0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
WASHC2DQ5SRD0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
WASHC2DQ5SRD0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
WASHC2DQ5SRD0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
WASHC2DQ5SRD0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
WASHC2DQ5SRD0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
WASHC2DQ5SRD0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
WASHC2DQ5SRD0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
WASHC2DQ5SRD0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
WASHC2DQ5SRD0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
WASHC2DQ5SRD0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
WASHC2DQ5SRD0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
WASHC2DQ5SRD0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
WASHC2DQ5SRD0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
WASHC2DQ5SRD0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
WASHC2DQ5SRD0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
WASHC2DQ5SRD0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms