Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COLEC12Q5KU26 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COLEC12Q5KU26 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COLEC12Q5KU26 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COLEC12Q5KU26 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COLEC12Q5KU26 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COLEC12Q5KU26 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COLEC12Q5KU26 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COLEC12Q5KU26 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COLEC12Q5KU26 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COLEC12Q5KU26 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COLEC12Q5KU26 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COLEC12Q5KU26 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
COLEC12Q5KU26 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COLEC12Q5KU26 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COLEC12Q5KU26 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COLEC12Q5KU26 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COLEC12Q5KU26 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COLEC12Q5KU26 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COLEC12Q5KU26 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
COLEC12Q5KU26 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COLEC12Q5KU26 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COLEC12Q5KU26 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COLEC12Q5KU26 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COLEC12Q5KU26 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
COLEC12Q5KU26 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COLEC12Q5KU26 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COLEC12Q5KU26 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COLEC12Q5KU26 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COLEC12Q5KU26 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COLEC12Q5KU26 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COLEC12Q5KU26 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COLEC12Q5KU26 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COLEC12Q5KU26 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COLEC12Q5KU26 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
COLEC12Q5KU26 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
COLEC12Q5KU26 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COLEC12Q5KU26 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COLEC12Q5KU26 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COLEC12Q5KU26 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COLEC12Q5KU26 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COLEC12Q5KU26 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COLEC12Q5KU26 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COLEC12Q5KU26 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
COLEC12Q5KU26 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COLEC12Q5KU26 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COLEC12Q5KU26 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COLEC12Q5KU26 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COLEC12Q5KU26 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COLEC12Q5KU26 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COLEC12Q5KU26 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COLEC12Q5KU26 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COLEC12Q5KU26 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COLEC12Q5KU26 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COLEC12Q5KU26 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COLEC12Q5KU26 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COLEC12Q5KU26 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COLEC12Q5KU26 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COLEC12Q5KU26 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COLEC12Q5KU26 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COLEC12Q5KU26 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COLEC12Q5KU26 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COLEC12Q5KU26 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COLEC12Q5KU26 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COLEC12Q5KU26 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COLEC12Q5KU26 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COLEC12Q5KU26 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COLEC12Q5KU26 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COLEC12Q5KU26 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COLEC12Q5KU26 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COLEC12Q5KU26 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COLEC12Q5KU26 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COLEC12Q5KU26 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COLEC12Q5KU26 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COLEC12Q5KU26 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COLEC12Q5KU26 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COLEC12Q5KU26 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COLEC12Q5KU26 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
COLEC12Q5KU26 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COLEC12Q5KU26 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
COLEC12Q5KU26 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COLEC12Q5KU26 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COLEC12Q5KU26 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COLEC12Q5KU26 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COLEC12Q5KU26 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
COLEC12Q5KU26 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COLEC12Q5KU26 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COLEC12Q5KU26 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COLEC12Q5KU26 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COLEC12Q5KU26 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COLEC12Q5KU26 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COLEC12Q5KU26 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COLEC12Q5KU26 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COLEC12Q5KU26 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
COLEC12Q5KU26 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COLEC12Q5KU26 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COLEC12Q5KU26 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COLEC12Q5KU26 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COLEC12Q5KU26 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COLEC12Q5KU26 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms