Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX6

SLC45A4, Solute carrier family 45 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC45A4Q5BKX6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC45A4Q5BKX6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC45A4Q5BKX6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC45A4Q5BKX6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC45A4Q5BKX6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC45A4Q5BKX6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC45A4Q5BKX6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC45A4Q5BKX6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC45A4Q5BKX6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC45A4Q5BKX6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC45A4Q5BKX6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC45A4Q5BKX6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC45A4Q5BKX6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC45A4Q5BKX6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC45A4Q5BKX6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC45A4Q5BKX6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC45A4Q5BKX6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC45A4Q5BKX6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC45A4Q5BKX6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC45A4Q5BKX6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC45A4Q5BKX6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC45A4Q5BKX6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC45A4Q5BKX6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC45A4Q5BKX6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC45A4Q5BKX6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC45A4Q5BKX6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC45A4Q5BKX6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC45A4Q5BKX6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC45A4Q5BKX6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC45A4Q5BKX6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC45A4Q5BKX6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC45A4Q5BKX6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC45A4Q5BKX6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC45A4Q5BKX6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC45A4Q5BKX6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC45A4Q5BKX6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC45A4Q5BKX6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC45A4Q5BKX6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC45A4Q5BKX6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC45A4Q5BKX6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC45A4Q5BKX6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC45A4Q5BKX6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC45A4Q5BKX6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC45A4Q5BKX6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC45A4Q5BKX6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC45A4Q5BKX6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC45A4Q5BKX6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC45A4Q5BKX6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC45A4Q5BKX6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC45A4Q5BKX6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC45A4Q5BKX6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC45A4Q5BKX6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC45A4Q5BKX6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC45A4Q5BKX6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC45A4Q5BKX6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC45A4Q5BKX6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC45A4Q5BKX6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC45A4Q5BKX6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC45A4Q5BKX6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC45A4Q5BKX6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC45A4Q5BKX6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC45A4Q5BKX6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC45A4Q5BKX6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC45A4Q5BKX6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC45A4Q5BKX6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC45A4Q5BKX6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC45A4Q5BKX6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC45A4Q5BKX6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC45A4Q5BKX6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC45A4Q5BKX6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC45A4Q5BKX6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC45A4Q5BKX6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC45A4Q5BKX6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC45A4Q5BKX6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC45A4Q5BKX6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC45A4Q5BKX6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC45A4Q5BKX6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC45A4Q5BKX6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC45A4Q5BKX6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC45A4Q5BKX6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC45A4Q5BKX6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC45A4Q5BKX6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC45A4Q5BKX6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC45A4Q5BKX6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC45A4Q5BKX6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC45A4Q5BKX6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC45A4Q5BKX6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC45A4Q5BKX6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC45A4Q5BKX6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC45A4Q5BKX6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC45A4Q5BKX6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC45A4Q5BKX6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC45A4Q5BKX6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC45A4Q5BKX6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC45A4Q5BKX6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC45A4Q5BKX6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC45A4Q5BKX6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC45A4Q5BKX6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC45A4Q5BKX6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC45A4Q5BKX6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms