Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDK2Q58EX2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDK2Q58EX2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDK2Q58EX2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDK2Q58EX2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDK2Q58EX2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDK2Q58EX2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDK2Q58EX2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SDK2Q58EX2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDK2Q58EX2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDK2Q58EX2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDK2Q58EX2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDK2Q58EX2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDK2Q58EX2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SDK2Q58EX2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDK2Q58EX2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDK2Q58EX2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDK2Q58EX2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDK2Q58EX2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SDK2Q58EX2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDK2Q58EX2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDK2Q58EX2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDK2Q58EX2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDK2Q58EX2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDK2Q58EX2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDK2Q58EX2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDK2Q58EX2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDK2Q58EX2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SDK2Q58EX2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDK2Q58EX2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDK2Q58EX2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDK2Q58EX2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDK2Q58EX2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDK2Q58EX2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDK2Q58EX2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SDK2Q58EX2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDK2Q58EX2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDK2Q58EX2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDK2Q58EX2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDK2Q58EX2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDK2Q58EX2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDK2Q58EX2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDK2Q58EX2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDK2Q58EX2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SDK2Q58EX2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDK2Q58EX2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDK2Q58EX2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDK2Q58EX2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDK2Q58EX2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDK2Q58EX2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDK2Q58EX2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDK2Q58EX2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDK2Q58EX2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDK2Q58EX2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDK2Q58EX2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDK2Q58EX2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDK2Q58EX2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDK2Q58EX2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDK2Q58EX2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDK2Q58EX2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDK2Q58EX2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDK2Q58EX2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDK2Q58EX2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDK2Q58EX2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDK2Q58EX2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDK2Q58EX2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDK2Q58EX2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDK2Q58EX2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDK2Q58EX2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDK2Q58EX2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDK2Q58EX2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDK2Q58EX2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDK2Q58EX2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDK2Q58EX2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDK2Q58EX2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDK2Q58EX2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDK2Q58EX2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SDK2Q58EX2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDK2Q58EX2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SDK2Q58EX2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDK2Q58EX2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDK2Q58EX2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDK2Q58EX2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDK2Q58EX2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDK2Q58EX2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDK2Q58EX2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDK2Q58EX2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDK2Q58EX2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDK2Q58EX2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDK2Q58EX2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDK2Q58EX2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDK2Q58EX2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDK2Q58EX2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDK2Q58EX2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDK2Q58EX2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDK2Q58EX2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDK2Q58EX2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDK2Q58EX2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDK2Q58EX2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDK2Q58EX2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms