Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFTN2Q52LD8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFTN2Q52LD8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFTN2Q52LD8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFTN2Q52LD8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFTN2Q52LD8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFTN2Q52LD8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFTN2Q52LD8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFTN2Q52LD8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RFTN2Q52LD8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFTN2Q52LD8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFTN2Q52LD8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFTN2Q52LD8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFTN2Q52LD8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFTN2Q52LD8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFTN2Q52LD8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFTN2Q52LD8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFTN2Q52LD8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFTN2Q52LD8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFTN2Q52LD8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFTN2Q52LD8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFTN2Q52LD8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFTN2Q52LD8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFTN2Q52LD8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFTN2Q52LD8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFTN2Q52LD8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFTN2Q52LD8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFTN2Q52LD8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFTN2Q52LD8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFTN2Q52LD8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFTN2Q52LD8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFTN2Q52LD8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RFTN2Q52LD8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFTN2Q52LD8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFTN2Q52LD8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFTN2Q52LD8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFTN2Q52LD8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFTN2Q52LD8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFTN2Q52LD8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFTN2Q52LD8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFTN2Q52LD8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFTN2Q52LD8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFTN2Q52LD8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFTN2Q52LD8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFTN2Q52LD8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFTN2Q52LD8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFTN2Q52LD8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFTN2Q52LD8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFTN2Q52LD8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFTN2Q52LD8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFTN2Q52LD8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFTN2Q52LD8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFTN2Q52LD8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFTN2Q52LD8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFTN2Q52LD8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFTN2Q52LD8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFTN2Q52LD8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RFTN2Q52LD8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RFTN2Q52LD8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFTN2Q52LD8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFTN2Q52LD8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RFTN2Q52LD8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFTN2Q52LD8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFTN2Q52LD8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFTN2Q52LD8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFTN2Q52LD8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFTN2Q52LD8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFTN2Q52LD8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFTN2Q52LD8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFTN2Q52LD8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFTN2Q52LD8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFTN2Q52LD8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RFTN2Q52LD8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFTN2Q52LD8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFTN2Q52LD8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFTN2Q52LD8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFTN2Q52LD8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFTN2Q52LD8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFTN2Q52LD8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFTN2Q52LD8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFTN2Q52LD8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFTN2Q52LD8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RFTN2Q52LD8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RFTN2Q52LD8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFTN2Q52LD8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFTN2Q52LD8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFTN2Q52LD8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFTN2Q52LD8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFTN2Q52LD8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFTN2Q52LD8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFTN2Q52LD8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFTN2Q52LD8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFTN2Q52LD8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFTN2Q52LD8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFTN2Q52LD8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFTN2Q52LD8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFTN2Q52LD8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFTN2Q52LD8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFTN2Q52LD8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFTN2Q52LD8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms