Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC38Q502W7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC38Q502W7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC38Q502W7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC38Q502W7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC38Q502W7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC38Q502W7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC38Q502W7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC38Q502W7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC38Q502W7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC38Q502W7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC38Q502W7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC38Q502W7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC38Q502W7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC38Q502W7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC38Q502W7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC38Q502W7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC38Q502W7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC38Q502W7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC38Q502W7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC38Q502W7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC38Q502W7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC38Q502W7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC38Q502W7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC38Q502W7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC38Q502W7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC38Q502W7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC38Q502W7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC38Q502W7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC38Q502W7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC38Q502W7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC38Q502W7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC38Q502W7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC38Q502W7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC38Q502W7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC38Q502W7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC38Q502W7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC38Q502W7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC38Q502W7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC38Q502W7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC38Q502W7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC38Q502W7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC38Q502W7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC38Q502W7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC38Q502W7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC38Q502W7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC38Q502W7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC38Q502W7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC38Q502W7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC38Q502W7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC38Q502W7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC38Q502W7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC38Q502W7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC38Q502W7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC38Q502W7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC38Q502W7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC38Q502W7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC38Q502W7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC38Q502W7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC38Q502W7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC38Q502W7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC38Q502W7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC38Q502W7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC38Q502W7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC38Q502W7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC38Q502W7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC38Q502W7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC38Q502W7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC38Q502W7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC38Q502W7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC38Q502W7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC38Q502W7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC38Q502W7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC38Q502W7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC38Q502W7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC38Q502W7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC38Q502W7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC38Q502W7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC38Q502W7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC38Q502W7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC38Q502W7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC38Q502W7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC38Q502W7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC38Q502W7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC38Q502W7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC38Q502W7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC38Q502W7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC38Q502W7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC38Q502W7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC38Q502W7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC38Q502W7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC38Q502W7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC38Q502W7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC38Q502W7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC38Q502W7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC38Q502W7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC38Q502W7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC38Q502W7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC38Q502W7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC38Q502W7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms