Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
FHOD3Q2V2M9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
FHOD3Q2V2M9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
FHOD3Q2V2M9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
FHOD3Q2V2M9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
FHOD3Q2V2M9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.8
FHOD3Q2V2M9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
FHOD3Q2V2M9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
FHOD3Q2V2M9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC38.8■■■■□ 3.8
FHOD3Q2V2M9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
FHOD3Q2V2M9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
FHOD3Q2V2M9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
FHOD3Q2V2M9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
FHOD3Q2V2M9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
FHOD3Q2V2M9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
FHOD3Q2V2M9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
FHOD3Q2V2M9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
FHOD3Q2V2M9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
FHOD3Q2V2M9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
FHOD3Q2V2M9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
FHOD3Q2V2M9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC38.78■■■■□ 3.8
FHOD3Q2V2M9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
FHOD3Q2V2M9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
FHOD3Q2V2M9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
FHOD3Q2V2M9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
FHOD3Q2V2M9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
FHOD3Q2V2M9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.76■■■■□ 3.8
FHOD3Q2V2M9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
FHOD3Q2V2M9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
FHOD3Q2V2M9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.75■■■■□ 3.79
FHOD3Q2V2M9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
FHOD3Q2V2M9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
FHOD3Q2V2M9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
FHOD3Q2V2M9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
FHOD3Q2V2M9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
FHOD3Q2V2M9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
FHOD3Q2V2M9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
FHOD3Q2V2M9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
FHOD3Q2V2M9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
FHOD3Q2V2M9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
FHOD3Q2V2M9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC38.72■■■■□ 3.79
FHOD3Q2V2M9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
FHOD3Q2V2M9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
FHOD3Q2V2M9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
FHOD3Q2V2M9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC38.72■■■■□ 3.79
FHOD3Q2V2M9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
FHOD3Q2V2M9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
FHOD3Q2V2M9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
FHOD3Q2V2M9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
FHOD3Q2V2M9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
FHOD3Q2V2M9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
FHOD3Q2V2M9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
FHOD3Q2V2M9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC38.71■■■■□ 3.79
FHOD3Q2V2M9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
FHOD3Q2V2M9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
FHOD3Q2V2M9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
FHOD3Q2V2M9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
FHOD3Q2V2M9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
FHOD3Q2V2M9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
FHOD3Q2V2M9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
FHOD3Q2V2M9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
FHOD3Q2V2M9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
FHOD3Q2V2M9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC38.67■■■■□ 3.78
FHOD3Q2V2M9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
FHOD3Q2V2M9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
FHOD3Q2V2M9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
FHOD3Q2V2M9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
FHOD3Q2V2M9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
FHOD3Q2V2M9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
FHOD3Q2V2M9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
FHOD3Q2V2M9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
FHOD3Q2V2M9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
FHOD3Q2V2M9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
FHOD3Q2V2M9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC38.63■■■■□ 3.78
FHOD3Q2V2M9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
FHOD3Q2V2M9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
FHOD3Q2V2M9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
FHOD3Q2V2M9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
FHOD3Q2V2M9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
FHOD3Q2V2M9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
FHOD3Q2V2M9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
FHOD3Q2V2M9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
FHOD3Q2V2M9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
FHOD3Q2V2M9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
FHOD3Q2V2M9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
FHOD3Q2V2M9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
FHOD3Q2V2M9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
FHOD3Q2V2M9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
FHOD3Q2V2M9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
FHOD3Q2V2M9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
FHOD3Q2V2M9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
FHOD3Q2V2M9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
FHOD3Q2V2M9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.77
FHOD3Q2V2M9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
FHOD3Q2V2M9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
FHOD3Q2V2M9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
FHOD3Q2V2M9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
FHOD3Q2V2M9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
FHOD3Q2V2M9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
FHOD3Q2V2M9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms