Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZIC1Q15915 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZIC1Q15915 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZIC1Q15915 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZIC1Q15915 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZIC1Q15915 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZIC1Q15915 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZIC1Q15915 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZIC1Q15915 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZIC1Q15915 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZIC1Q15915 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ZIC1Q15915 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZIC1Q15915 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZIC1Q15915 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZIC1Q15915 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZIC1Q15915 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZIC1Q15915 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZIC1Q15915 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZIC1Q15915 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZIC1Q15915 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZIC1Q15915 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZIC1Q15915 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZIC1Q15915 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZIC1Q15915 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZIC1Q15915 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZIC1Q15915 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZIC1Q15915 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZIC1Q15915 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZIC1Q15915 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZIC1Q15915 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZIC1Q15915 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZIC1Q15915 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZIC1Q15915 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZIC1Q15915 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZIC1Q15915 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZIC1Q15915 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZIC1Q15915 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZIC1Q15915 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZIC1Q15915 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZIC1Q15915 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZIC1Q15915 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZIC1Q15915 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZIC1Q15915 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZIC1Q15915 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZIC1Q15915 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZIC1Q15915 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZIC1Q15915 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZIC1Q15915 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZIC1Q15915 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZIC1Q15915 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZIC1Q15915 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZIC1Q15915 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZIC1Q15915 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZIC1Q15915 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZIC1Q15915 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZIC1Q15915 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZIC1Q15915 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZIC1Q15915 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZIC1Q15915 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZIC1Q15915 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZIC1Q15915 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZIC1Q15915 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZIC1Q15915 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZIC1Q15915 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZIC1Q15915 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZIC1Q15915 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZIC1Q15915 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZIC1Q15915 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZIC1Q15915 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZIC1Q15915 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZIC1Q15915 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZIC1Q15915 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZIC1Q15915 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZIC1Q15915 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZIC1Q15915 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZIC1Q15915 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZIC1Q15915 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZIC1Q15915 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZIC1Q15915 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZIC1Q15915 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZIC1Q15915 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZIC1Q15915 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZIC1Q15915 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZIC1Q15915 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZIC1Q15915 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ZIC1Q15915 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ZIC1Q15915 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZIC1Q15915 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZIC1Q15915 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZIC1Q15915 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZIC1Q15915 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZIC1Q15915 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZIC1Q15915 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZIC1Q15915 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ZIC1Q15915 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZIC1Q15915 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZIC1Q15915 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZIC1Q15915 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZIC1Q15915 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZIC1Q15915 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms