Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SF1Q15637 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SF1Q15637 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SF1Q15637 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SF1Q15637 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SF1Q15637 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SF1Q15637 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SF1Q15637 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SF1Q15637 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SF1Q15637 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SF1Q15637 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SF1Q15637 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SF1Q15637 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SF1Q15637 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SF1Q15637 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SF1Q15637 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SF1Q15637 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SF1Q15637 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SF1Q15637 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SF1Q15637 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SF1Q15637 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SF1Q15637 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SF1Q15637 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SF1Q15637 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SF1Q15637 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SF1Q15637 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SF1Q15637 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SF1Q15637 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SF1Q15637 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SF1Q15637 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SF1Q15637 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SF1Q15637 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SF1Q15637 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SF1Q15637 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SF1Q15637 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SF1Q15637 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SF1Q15637 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SF1Q15637 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SF1Q15637 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SF1Q15637 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SF1Q15637 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SF1Q15637 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SF1Q15637 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SF1Q15637 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SF1Q15637 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SF1Q15637 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SF1Q15637 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SF1Q15637 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SF1Q15637 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SF1Q15637 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SF1Q15637 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SF1Q15637 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SF1Q15637 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SF1Q15637 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SF1Q15637 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SF1Q15637 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SF1Q15637 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SF1Q15637 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SF1Q15637 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SF1Q15637 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SF1Q15637 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SF1Q15637 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SF1Q15637 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SF1Q15637 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SF1Q15637 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SF1Q15637 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SF1Q15637 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SF1Q15637 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SF1Q15637 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SF1Q15637 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SF1Q15637 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SF1Q15637 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SF1Q15637 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SF1Q15637 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SF1Q15637 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SF1Q15637 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SF1Q15637 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SF1Q15637 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SF1Q15637 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SF1Q15637 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SF1Q15637 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SF1Q15637 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SF1Q15637 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SF1Q15637 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SF1Q15637 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SF1Q15637 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SF1Q15637 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SF1Q15637 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SF1Q15637 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SF1Q15637 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SF1Q15637 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SF1Q15637 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SF1Q15637 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SF1Q15637 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SF1Q15637 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SF1Q15637 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SF1Q15637 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SF1Q15637 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SF1Q15637 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SF1Q15637 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms