Protein–RNA interactions for Protein: Q15291

RBBP5, Retinoblastoma-binding protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP5Q15291 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBBP5Q15291 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBBP5Q15291 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBBP5Q15291 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBBP5Q15291 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBBP5Q15291 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBBP5Q15291 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBBP5Q15291 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBBP5Q15291 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBBP5Q15291 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBBP5Q15291 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBBP5Q15291 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBBP5Q15291 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBBP5Q15291 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBBP5Q15291 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBBP5Q15291 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBBP5Q15291 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBBP5Q15291 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBBP5Q15291 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBBP5Q15291 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBBP5Q15291 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBBP5Q15291 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBBP5Q15291 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBBP5Q15291 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBBP5Q15291 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RBBP5Q15291 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBBP5Q15291 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBBP5Q15291 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBBP5Q15291 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBBP5Q15291 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBBP5Q15291 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBBP5Q15291 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RBBP5Q15291 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBBP5Q15291 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBBP5Q15291 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBBP5Q15291 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBBP5Q15291 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBBP5Q15291 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBBP5Q15291 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBBP5Q15291 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBBP5Q15291 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBBP5Q15291 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBBP5Q15291 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RBBP5Q15291 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBBP5Q15291 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBBP5Q15291 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBBP5Q15291 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBBP5Q15291 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBBP5Q15291 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBBP5Q15291 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBBP5Q15291 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBBP5Q15291 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBBP5Q15291 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBBP5Q15291 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBBP5Q15291 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RBBP5Q15291 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBBP5Q15291 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBBP5Q15291 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBBP5Q15291 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBBP5Q15291 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBBP5Q15291 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBBP5Q15291 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RBBP5Q15291 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBBP5Q15291 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBBP5Q15291 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBBP5Q15291 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBBP5Q15291 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBBP5Q15291 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBBP5Q15291 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RBBP5Q15291 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBBP5Q15291 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBBP5Q15291 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBBP5Q15291 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RBBP5Q15291 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBBP5Q15291 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBBP5Q15291 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBBP5Q15291 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBBP5Q15291 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBBP5Q15291 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBBP5Q15291 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBBP5Q15291 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBBP5Q15291 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBBP5Q15291 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBBP5Q15291 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBBP5Q15291 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBBP5Q15291 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBBP5Q15291 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBBP5Q15291 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBBP5Q15291 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBBP5Q15291 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBBP5Q15291 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBBP5Q15291 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBBP5Q15291 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBBP5Q15291 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBBP5Q15291 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBBP5Q15291 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBBP5Q15291 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBBP5Q15291 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBBP5Q15291 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBBP5Q15291 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms