Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PTPRKQ15262 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
PTPRKQ15262 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
PTPRKQ15262 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PTPRKQ15262 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
PTPRKQ15262 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
PTPRKQ15262 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
PTPRKQ15262 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
PTPRKQ15262 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
PTPRKQ15262 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
PTPRKQ15262 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
PTPRKQ15262 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
PTPRKQ15262 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
PTPRKQ15262 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
PTPRKQ15262 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PTPRKQ15262 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
PTPRKQ15262 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PTPRKQ15262 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
PTPRKQ15262 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
PTPRKQ15262 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PTPRKQ15262 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC36.81■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC36.77■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.47
PTPRKQ15262 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
PTPRKQ15262 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
PTPRKQ15262 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
PTPRKQ15262 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PTPRKQ15262 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
PTPRKQ15262 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
PTPRKQ15262 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PTPRKQ15262 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PTPRKQ15262 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
PTPRKQ15262 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
PTPRKQ15262 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PTPRKQ15262 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PTPRKQ15262 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PTPRKQ15262 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PTPRKQ15262 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PTPRKQ15262 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PTPRKQ15262 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.8 ms