Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEDD9Q14511 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEDD9Q14511 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEDD9Q14511 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEDD9Q14511 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEDD9Q14511 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEDD9Q14511 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEDD9Q14511 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEDD9Q14511 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEDD9Q14511 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEDD9Q14511 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NEDD9Q14511 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEDD9Q14511 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEDD9Q14511 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEDD9Q14511 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEDD9Q14511 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NEDD9Q14511 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEDD9Q14511 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEDD9Q14511 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEDD9Q14511 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEDD9Q14511 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEDD9Q14511 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NEDD9Q14511 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEDD9Q14511 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEDD9Q14511 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEDD9Q14511 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEDD9Q14511 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEDD9Q14511 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEDD9Q14511 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEDD9Q14511 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEDD9Q14511 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEDD9Q14511 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NEDD9Q14511 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEDD9Q14511 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEDD9Q14511 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEDD9Q14511 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEDD9Q14511 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NEDD9Q14511 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEDD9Q14511 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEDD9Q14511 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEDD9Q14511 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEDD9Q14511 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEDD9Q14511 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEDD9Q14511 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEDD9Q14511 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NEDD9Q14511 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEDD9Q14511 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NEDD9Q14511 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NEDD9Q14511 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEDD9Q14511 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEDD9Q14511 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEDD9Q14511 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEDD9Q14511 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEDD9Q14511 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEDD9Q14511 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEDD9Q14511 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEDD9Q14511 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
NEDD9Q14511 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEDD9Q14511 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NEDD9Q14511 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NEDD9Q14511 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEDD9Q14511 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEDD9Q14511 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEDD9Q14511 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEDD9Q14511 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEDD9Q14511 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEDD9Q14511 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEDD9Q14511 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NEDD9Q14511 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEDD9Q14511 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEDD9Q14511 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEDD9Q14511 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEDD9Q14511 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEDD9Q14511 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEDD9Q14511 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEDD9Q14511 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEDD9Q14511 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NEDD9Q14511 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NEDD9Q14511 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEDD9Q14511 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEDD9Q14511 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEDD9Q14511 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEDD9Q14511 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEDD9Q14511 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NEDD9Q14511 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEDD9Q14511 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEDD9Q14511 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NEDD9Q14511 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEDD9Q14511 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEDD9Q14511 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEDD9Q14511 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEDD9Q14511 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEDD9Q14511 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEDD9Q14511 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEDD9Q14511 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEDD9Q14511 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEDD9Q14511 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEDD9Q14511 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEDD9Q14511 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEDD9Q14511 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
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