Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLF9Q13886 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLF9Q13886 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLF9Q13886 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLF9Q13886 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLF9Q13886 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLF9Q13886 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLF9Q13886 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLF9Q13886 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
KLF9Q13886 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
KLF9Q13886 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLF9Q13886 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLF9Q13886 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLF9Q13886 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLF9Q13886 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLF9Q13886 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLF9Q13886 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLF9Q13886 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLF9Q13886 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLF9Q13886 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLF9Q13886 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLF9Q13886 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLF9Q13886 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLF9Q13886 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLF9Q13886 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLF9Q13886 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLF9Q13886 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF9Q13886 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF9Q13886 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF9Q13886 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF9Q13886 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF9Q13886 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF9Q13886 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF9Q13886 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF9Q13886 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF9Q13886 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF9Q13886 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF9Q13886 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF9Q13886 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF9Q13886 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF9Q13886 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF9Q13886 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF9Q13886 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF9Q13886 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLF9Q13886 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLF9Q13886 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KLF9Q13886 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLF9Q13886 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLF9Q13886 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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