Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNTB1Q13884 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNTB1Q13884 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNTB1Q13884 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNTB1Q13884 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNTB1Q13884 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNTB1Q13884 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNTB1Q13884 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SNTB1Q13884 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SNTB1Q13884 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNTB1Q13884 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNTB1Q13884 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNTB1Q13884 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNTB1Q13884 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNTB1Q13884 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNTB1Q13884 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNTB1Q13884 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNTB1Q13884 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNTB1Q13884 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNTB1Q13884 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNTB1Q13884 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SNTB1Q13884 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SNTB1Q13884 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNTB1Q13884 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNTB1Q13884 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNTB1Q13884 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNTB1Q13884 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNTB1Q13884 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNTB1Q13884 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNTB1Q13884 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNTB1Q13884 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNTB1Q13884 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SNTB1Q13884 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNTB1Q13884 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNTB1Q13884 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNTB1Q13884 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNTB1Q13884 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNTB1Q13884 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNTB1Q13884 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNTB1Q13884 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNTB1Q13884 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNTB1Q13884 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNTB1Q13884 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNTB1Q13884 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNTB1Q13884 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNTB1Q13884 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNTB1Q13884 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNTB1Q13884 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNTB1Q13884 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SNTB1Q13884 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNTB1Q13884 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNTB1Q13884 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNTB1Q13884 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNTB1Q13884 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNTB1Q13884 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNTB1Q13884 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNTB1Q13884 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNTB1Q13884 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNTB1Q13884 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNTB1Q13884 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNTB1Q13884 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNTB1Q13884 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNTB1Q13884 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNTB1Q13884 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNTB1Q13884 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SNTB1Q13884 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNTB1Q13884 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNTB1Q13884 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNTB1Q13884 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNTB1Q13884 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNTB1Q13884 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNTB1Q13884 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SNTB1Q13884 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNTB1Q13884 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNTB1Q13884 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNTB1Q13884 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNTB1Q13884 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNTB1Q13884 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNTB1Q13884 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNTB1Q13884 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNTB1Q13884 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNTB1Q13884 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNTB1Q13884 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNTB1Q13884 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNTB1Q13884 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNTB1Q13884 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNTB1Q13884 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SNTB1Q13884 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNTB1Q13884 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNTB1Q13884 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SNTB1Q13884 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNTB1Q13884 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNTB1Q13884 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNTB1Q13884 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNTB1Q13884 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNTB1Q13884 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNTB1Q13884 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNTB1Q13884 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNTB1Q13884 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNTB1Q13884 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.2 ms