Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEMA3FQ13275 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEMA3FQ13275 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEMA3FQ13275 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEMA3FQ13275 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEMA3FQ13275 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEMA3FQ13275 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEMA3FQ13275 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEMA3FQ13275 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEMA3FQ13275 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEMA3FQ13275 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEMA3FQ13275 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEMA3FQ13275 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEMA3FQ13275 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SEMA3FQ13275 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SEMA3FQ13275 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SEMA3FQ13275 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SEMA3FQ13275 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SEMA3FQ13275 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEMA3FQ13275 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEMA3FQ13275 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEMA3FQ13275 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEMA3FQ13275 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEMA3FQ13275 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEMA3FQ13275 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEMA3FQ13275 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEMA3FQ13275 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEMA3FQ13275 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEMA3FQ13275 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEMA3FQ13275 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEMA3FQ13275 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEMA3FQ13275 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEMA3FQ13275 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEMA3FQ13275 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEMA3FQ13275 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEMA3FQ13275 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEMA3FQ13275 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SEMA3FQ13275 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEMA3FQ13275 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SEMA3FQ13275 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SEMA3FQ13275 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SEMA3FQ13275 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SEMA3FQ13275 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SEMA3FQ13275 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SEMA3FQ13275 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SEMA3FQ13275 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SEMA3FQ13275 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SEMA3FQ13275 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SEMA3FQ13275 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SEMA3FQ13275 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SEMA3FQ13275 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SEMA3FQ13275 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SEMA3FQ13275 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SEMA3FQ13275 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SEMA3FQ13275 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SEMA3FQ13275 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SEMA3FQ13275 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SEMA3FQ13275 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SEMA3FQ13275 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SEMA3FQ13275 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SEMA3FQ13275 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SEMA3FQ13275 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SEMA3FQ13275 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SEMA3FQ13275 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SEMA3FQ13275 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SEMA3FQ13275 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SEMA3FQ13275 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SEMA3FQ13275 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SEMA3FQ13275 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SEMA3FQ13275 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SEMA3FQ13275 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SEMA3FQ13275 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SEMA3FQ13275 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SEMA3FQ13275 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SEMA3FQ13275 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SEMA3FQ13275 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEMA3FQ13275 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEMA3FQ13275 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEMA3FQ13275 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEMA3FQ13275 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEMA3FQ13275 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEMA3FQ13275 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEMA3FQ13275 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEMA3FQ13275 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEMA3FQ13275 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEMA3FQ13275 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SEMA3FQ13275 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEMA3FQ13275 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEMA3FQ13275 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEMA3FQ13275 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEMA3FQ13275 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEMA3FQ13275 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEMA3FQ13275 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEMA3FQ13275 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEMA3FQ13275 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEMA3FQ13275 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEMA3FQ13275 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SEMA3FQ13275 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEMA3FQ13275 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEMA3FQ13275 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
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