Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACACAQ13085 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ACACAQ13085 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACACAQ13085 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACACAQ13085 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ACACAQ13085 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACACAQ13085 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACACAQ13085 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACACAQ13085 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACACAQ13085 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACACAQ13085 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ACACAQ13085 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ACACAQ13085 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACACAQ13085 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACACAQ13085 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACACAQ13085 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACACAQ13085 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACACAQ13085 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACACAQ13085 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACACAQ13085 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACACAQ13085 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ACACAQ13085 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ACACAQ13085 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACACAQ13085 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACACAQ13085 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACACAQ13085 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACACAQ13085 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACACAQ13085 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACACAQ13085 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ACACAQ13085 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACACAQ13085 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACACAQ13085 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ACACAQ13085 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACACAQ13085 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACACAQ13085 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACACAQ13085 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACACAQ13085 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACACAQ13085 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACACAQ13085 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACACAQ13085 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACACAQ13085 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACACAQ13085 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ACACAQ13085 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACACAQ13085 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACACAQ13085 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACACAQ13085 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ACACAQ13085 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACACAQ13085 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACACAQ13085 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACACAQ13085 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACACAQ13085 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACACAQ13085 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ACACAQ13085 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACACAQ13085 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACACAQ13085 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACACAQ13085 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACACAQ13085 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACACAQ13085 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACACAQ13085 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACACAQ13085 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACACAQ13085 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACACAQ13085 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACACAQ13085 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACACAQ13085 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACACAQ13085 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACACAQ13085 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACACAQ13085 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACACAQ13085 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACACAQ13085 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACACAQ13085 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACACAQ13085 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACACAQ13085 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACACAQ13085 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACACAQ13085 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACACAQ13085 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACACAQ13085 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACACAQ13085 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACACAQ13085 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACACAQ13085 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACACAQ13085 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ACACAQ13085 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACACAQ13085 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACACAQ13085 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ACACAQ13085 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACACAQ13085 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACACAQ13085 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACACAQ13085 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACACAQ13085 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACACAQ13085 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACACAQ13085 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ACACAQ13085 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ACACAQ13085 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ACACAQ13085 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACACAQ13085 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACACAQ13085 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACACAQ13085 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACACAQ13085 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACACAQ13085 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACACAQ13085 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACACAQ13085 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 270.3 ms