Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDSRQ06136 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDSRQ06136 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDSRQ06136 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KDSRQ06136 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDSRQ06136 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDSRQ06136 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDSRQ06136 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms