Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNP2Q05952 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 407.7 ms