Protein–RNA interactions for Protein: Q04759

PRKCQ, Protein kinase C theta type, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQQ04759 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRKCQQ04759 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRKCQQ04759 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKCQQ04759 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKCQQ04759 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKCQQ04759 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKCQQ04759 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKCQQ04759 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKCQQ04759 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKCQQ04759 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKCQQ04759 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKCQQ04759 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKCQQ04759 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKCQQ04759 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKCQQ04759 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKCQQ04759 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKCQQ04759 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKCQQ04759 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKCQQ04759 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKCQQ04759 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKCQQ04759 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKCQQ04759 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKCQQ04759 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKCQQ04759 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKCQQ04759 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKCQQ04759 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKCQQ04759 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKCQQ04759 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKCQQ04759 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCQQ04759 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCQQ04759 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCQQ04759 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCQQ04759 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCQQ04759 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCQQ04759 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCQQ04759 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCQQ04759 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCQQ04759 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCQQ04759 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCQQ04759 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCQQ04759 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCQQ04759 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCQQ04759 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCQQ04759 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCQQ04759 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCQQ04759 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCQQ04759 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCQQ04759 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCQQ04759 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCQQ04759 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCQQ04759 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCQQ04759 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCQQ04759 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCQQ04759 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCQQ04759 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCQQ04759 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCQQ04759 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCQQ04759 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCQQ04759 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCQQ04759 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCQQ04759 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCQQ04759 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCQQ04759 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCQQ04759 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCQQ04759 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCQQ04759 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCQQ04759 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCQQ04759 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCQQ04759 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCQQ04759 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCQQ04759 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCQQ04759 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCQQ04759 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCQQ04759 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCQQ04759 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKCQQ04759 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKCQQ04759 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKCQQ04759 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKCQQ04759 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKCQQ04759 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCQQ04759 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCQQ04759 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCQQ04759 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCQQ04759 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCQQ04759 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCQQ04759 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCQQ04759 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCQQ04759 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCQQ04759 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCQQ04759 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCQQ04759 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKCQQ04759 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKCQQ04759 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKCQQ04759 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKCQQ04759 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCQQ04759 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCQQ04759 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCQQ04759 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCQQ04759 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCQQ04759 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.3 ms