Protein–RNA interactions for Protein: Q03252

LMNB2, Lamin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB2Q03252 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LMNB2Q03252 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LMNB2Q03252 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMNB2Q03252 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMNB2Q03252 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMNB2Q03252 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMNB2Q03252 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMNB2Q03252 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMNB2Q03252 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMNB2Q03252 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMNB2Q03252 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMNB2Q03252 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMNB2Q03252 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMNB2Q03252 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMNB2Q03252 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMNB2Q03252 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMNB2Q03252 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMNB2Q03252 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMNB2Q03252 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMNB2Q03252 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMNB2Q03252 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMNB2Q03252 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMNB2Q03252 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMNB2Q03252 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMNB2Q03252 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMNB2Q03252 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMNB2Q03252 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMNB2Q03252 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMNB2Q03252 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LMNB2Q03252 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LMNB2Q03252 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMNB2Q03252 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMNB2Q03252 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LMNB2Q03252 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMNB2Q03252 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMNB2Q03252 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMNB2Q03252 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMNB2Q03252 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMNB2Q03252 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMNB2Q03252 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMNB2Q03252 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMNB2Q03252 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMNB2Q03252 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMNB2Q03252 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMNB2Q03252 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMNB2Q03252 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMNB2Q03252 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LMNB2Q03252 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMNB2Q03252 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMNB2Q03252 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMNB2Q03252 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMNB2Q03252 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMNB2Q03252 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMNB2Q03252 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMNB2Q03252 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMNB2Q03252 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMNB2Q03252 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMNB2Q03252 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LMNB2Q03252 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMNB2Q03252 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMNB2Q03252 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMNB2Q03252 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMNB2Q03252 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMNB2Q03252 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMNB2Q03252 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMNB2Q03252 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMNB2Q03252 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMNB2Q03252 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMNB2Q03252 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMNB2Q03252 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMNB2Q03252 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMNB2Q03252 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMNB2Q03252 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMNB2Q03252 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMNB2Q03252 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMNB2Q03252 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMNB2Q03252 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMNB2Q03252 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LMNB2Q03252 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMNB2Q03252 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMNB2Q03252 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMNB2Q03252 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMNB2Q03252 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
LMNB2Q03252 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMNB2Q03252 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMNB2Q03252 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMNB2Q03252 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMNB2Q03252 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LMNB2Q03252 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMNB2Q03252 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMNB2Q03252 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMNB2Q03252 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMNB2Q03252 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMNB2Q03252 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMNB2Q03252 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMNB2Q03252 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMNB2Q03252 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMNB2Q03252 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMNB2Q03252 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMNB2Q03252 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms