Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CREMQ03060 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CREMQ03060 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CREMQ03060 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CREMQ03060 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CREMQ03060 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CREMQ03060 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CREMQ03060 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CREMQ03060 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CREMQ03060 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CREMQ03060 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CREMQ03060 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CREMQ03060 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CREMQ03060 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CREMQ03060 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CREMQ03060 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CREMQ03060 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CREMQ03060 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CREMQ03060 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CREMQ03060 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CREMQ03060 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CREMQ03060 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CREMQ03060 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CREMQ03060 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CREMQ03060 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CREMQ03060 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CREMQ03060 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CREMQ03060 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CREMQ03060 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CREMQ03060 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CREMQ03060 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CREMQ03060 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CREMQ03060 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CREMQ03060 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CREMQ03060 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CREMQ03060 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CREMQ03060 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CREMQ03060 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CREMQ03060 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CREMQ03060 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CREMQ03060 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CREMQ03060 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CREMQ03060 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CREMQ03060 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CREMQ03060 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CREMQ03060 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CREMQ03060 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CREMQ03060 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CREMQ03060 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CREMQ03060 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CREMQ03060 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CREMQ03060 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CREMQ03060 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CREMQ03060 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CREMQ03060 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CREMQ03060 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CREMQ03060 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CREMQ03060 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CREMQ03060 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CREMQ03060 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CREMQ03060 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CREMQ03060 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CREMQ03060 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CREMQ03060 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CREMQ03060 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CREMQ03060 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CREMQ03060 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CREMQ03060 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CREMQ03060 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CREMQ03060 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CREMQ03060 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CREMQ03060 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CREMQ03060 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CREMQ03060 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CREMQ03060 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CREMQ03060 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CREMQ03060 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CREMQ03060 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CREMQ03060 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CREMQ03060 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CREMQ03060 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CREMQ03060 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CREMQ03060 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CREMQ03060 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CREMQ03060 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CREMQ03060 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CREMQ03060 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CREMQ03060 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CREMQ03060 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CREMQ03060 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CREMQ03060 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CREMQ03060 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CREMQ03060 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CREMQ03060 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CREMQ03060 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CREMQ03060 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CREMQ03060 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CREMQ03060 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CREMQ03060 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CREMQ03060 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms