Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX1P78414 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX1P78414 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX1P78414 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX1P78414 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX1P78414 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX1P78414 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX1P78414 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX1P78414 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX1P78414 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRX1P78414 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRX1P78414 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRX1P78414 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRX1P78414 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRX1P78414 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX1P78414 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX1P78414 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX1P78414 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX1P78414 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX1P78414 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX1P78414 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX1P78414 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX1P78414 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX1P78414 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX1P78414 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX1P78414 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX1P78414 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX1P78414 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX1P78414 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX1P78414 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX1P78414 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX1P78414 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX1P78414 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX1P78414 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX1P78414 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX1P78414 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX1P78414 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX1P78414 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX1P78414 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX1P78414 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX1P78414 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX1P78414 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX1P78414 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX1P78414 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX1P78414 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX1P78414 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX1P78414 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX1P78414 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX1P78414 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX1P78414 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX1P78414 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRX1P78414 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRX1P78414 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRX1P78414 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRX1P78414 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRX1P78414 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRX1P78414 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRX1P78414 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IRX1P78414 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRX1P78414 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRX1P78414 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRX1P78414 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
IRX1P78414 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRX1P78414 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRX1P78414 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRX1P78414 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRX1P78414 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRX1P78414 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRX1P78414 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX1P78414 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX1P78414 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX1P78414 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX1P78414 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX1P78414 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX1P78414 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX1P78414 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX1P78414 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX1P78414 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX1P78414 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX1P78414 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX1P78414 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX1P78414 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX1P78414 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX1P78414 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX1P78414 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX1P78414 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX1P78414 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX1P78414 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX1P78414 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX1P78414 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX1P78414 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX1P78414 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX1P78414 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX1P78414 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX1P78414 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX1P78414 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX1P78414 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX1P78414 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX1P78414 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX1P78414 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms