Protein–RNA interactions for Protein: P62955

CACNG7, Voltage-dependent calcium channel gamma-7 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG7P62955 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG7P62955 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG7P62955 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG7P62955 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG7P62955 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNG7P62955 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNG7P62955 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNG7P62955 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNG7P62955 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNG7P62955 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNG7P62955 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNG7P62955 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CACNG7P62955 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CACNG7P62955 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CACNG7P62955 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNG7P62955 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNG7P62955 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNG7P62955 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNG7P62955 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNG7P62955 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNG7P62955 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNG7P62955 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNG7P62955 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNG7P62955 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNG7P62955 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNG7P62955 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNG7P62955 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNG7P62955 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNG7P62955 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNG7P62955 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNG7P62955 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNG7P62955 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNG7P62955 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNG7P62955 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNG7P62955 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNG7P62955 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNG7P62955 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms